Uso de DNA metabarcoding como ferramenta alternativa, resolutiva e de baixo custo ao DNA barcoding em estudos do ictioplâncton

• Processo: 17/12758-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2017
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2017
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Recursos Pesqueiros de Águas Interiores
• Pesquisador responsável: Claudio de Oliveira
• Beneficiário: André Batista Nobile
• Supervisor: Juan Pedro M. Camacho
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Universidad de Granada (UGR), Espanha
• Vinculado à bolsa: 15/19025-9 - Identificação de áreas prioritárias à conservação de espécies ameaçadas no rio Mogi-Guaçu utilizando técnicas de DNA barcode, BP.PD
• Assunto(s): Genética animal Recrutamento
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Recrutamento | Genética animal

Resumo

Estudos envolvendo ictioplâncton são de grande valia para projetos de manejo de espécies ameaçadas. Contudo, a correta identificação dos ovos e larvas é tarefa difícil mesmo para especialistas. Neste sentido, o uso de ferramentas moleculares, como o DNA barcoding, têm se mostrado uma alternativa eficaz e resolutiva em tais estudos, aumentando sua eficácia. Entretanto, em estudos de larga escala, com muitas amostras, o custo das análises do DNA Barcode e o tempo demandado para execução de todo o processo molecular, torna seu uso inviável. Assim, o uso do Metabarcoding pode ser uma alternativa mais acessível financeiramente e rápida, mantendo a capacidade de resolução dos estudos. Desta forma, o objetivo deste projeto é desenvolver um protocolo de análises de ovos e larvas com o uso do DNA Metabarcoding, para que, futuramente, esta técnica venha a ser usada em larga escala nos estudos relacionados a ovos e larvas.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DA COSTA, GABRIELA O.; NOBILE, ANDRE B.; LIMA, FELIPE P.; FREITAS-SOUZA, DIOGO; MANZANO, FELIPE V.; OLIVEIRA, CLAUDIO. Length-weight and length-length relationships for four fish species of Upper Paranaiba river basin, Brazil. Journal of Applied Ichthyology, v. 35, n. 2, p. 619-621, APR 2019. (16/09204-6, 14/26508-3, 15/19025-9, 17/12758-6)

FREITAS-SOUZA, DIOGO; NOBILE, ANDRE BATISTA; DO PRADO, FERNANDA DOTTI; SERRANO, ERICA ALVES; LIMA, FELIPE PONTIERI; FORESTI, FAUSTO; PORTO-FORESTI, FABIO; OLIVEIRA, CLAUDIO. Genetic markers indicate that hybrids of Pseudoplatystoma (Siluriformes, Pimelodidae) are reproducing in natural environments in southeastern Brazil. Biological Invasions, v. 24, n. 4, p. 10-pg., 2022-01-16. (17/12758-6, 15/19025-9, 16/09204-6, 14/26508-3, 18/20610-1)