Análises de integração genética e de redes regulatórias para detectar genes associados com conteúdo de ferro no músculo e fenótipos relacionados a qualidade de carne em Nelore

• Processo: 17/20761-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2018
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2019
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Luciana Correia de Almeida Regitano
• Beneficiário: Wellison Jarles da Silva Diniz
• Supervisor: Haja Kadarmideen
• Instituição Sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Technical University of Denmark (DTU), Dinamarca
• Vinculado à bolsa: 15/09158-1 - Identificação de redes gênicas de coexpressão e dos mecanismos regulatórios associados à composição mineral e qualidade de carne em bovinos, BP.DR
• Assunto(s): Biologia de sistemas Genômica Qualidade da carne Homeostase Ferro
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Beef quality | Integrative genomics | Mineral Nutrition | systems biology | Systems biology

Resumo

A carne é uma fonte de nutrientes, principalmente ferro biodisponível. O ferro (Fe) é essencial para a saúde porque desempenha um papel importante em muitos processos biológicos e desequilíbrios na sua homeostase tem sido relacionado a doenças metabólicas. Apesar dos avanços genômicos, o conhecimento sobre a arquitetura genética subjacente à homeostase do conteúdo mineral no músculo bovino ainda é incipiente. O conteúdo de Fe no músculo é uma característica complexa resultante da interação coordenada de muitos genes. Além disso, SNPs em elementos regulatórios e miRNAs podem alterar a expressão gênica e contribuir para a variação fenotípica na população. Neste contexto, abordagens de genética de sistemas baseadas na integração de dados genômicos e transcriptômicos têm sido úteis na identificação de loci genéticos regulatórios relacionados a fenótipos complexos. Portanto, este estudo pretende investigar os mecanismos genéticos envolvidos na regulação do conteúdo de Fe no músculo Logissimus dorsi de novilhos Nelore e sua relação com fenótipos de qualidade de carne, integrando genômica (SNPs), transcriptômica (mRNAs e miRNAs) e dados fenotípicos. Redes de co-expressão gênica e de interação epistática serão construídas adotando as abordagens WGCNA e WISH. Os resultados obtidos contribuirão para a compreensão da interação SNPs-miRNA-mRNA, da homeostase do Fe no músculo e sua relação com características de qualidade da carne bovina. Além disso, essas informações podem contribuir para o desenvolvimento de produtos cárneos de maior valor nutricional. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DINIZ, WELLISON J. S.; MAZZONI, GIANLUCA; COUTINHO, LUIZ L.; BANERJEE, PRIYANKA; GEISTLINGER, LUDWIG; CESAR, ALINE S. M.; BERTOLINI, FRANCESCA; AFONSO, JULIANA; DE OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; TIZIOTO, POLYANA C.; et al. Detection of Co-expressed Pathway Modules Associated With Mineral Concentration and Meat Quality in Nelore Cattle. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, MAR 13 2019. (12/23638-8, 15/09158-1, 17/20761-7)

DA SILVA DINIZ, WELLISON JARLES; BANERJEE, PRIYANKA; MAZZONI, GIANLUCA; COUTINHO, LUIZ LEHMANN; MELLO CESAR, ALINE SILVA; AFONSO, JULIANA; GROMBONI, CAIO FERNANDO; ARAUJO NOGUEIRA, ANA RITA; KADARMIDEEN, HAJA N.; DE ALMEIDA REGITANO, LUCIANA CORREIA. Interplay among miR-29 family, mineral metabolism, and gene regulation in Bos indicus muscle. Molecular Genetics and Genomics, v. 295, n. 5, p. 1113-1127, SEP 2020. (17/20761-7, 12/23638-8, 15/09158-1)