Comunidade de fungos de ramos mortos usando sequenciamento de alto rendimento

• Processo: 17/27063-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 31 de março de 2018
• Data de Término da vigência: 29 de novembro de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia
• Pesquisador responsável: Adriana de Mello Gugliotta
• Beneficiário: Ricardo Matheus Pires
• Supervisor: Rasmus Kjoller
• Instituição Sede: Instituto de Botânica. Secretaria de Meio Ambiente, Infraestrutura e Logística (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Copenhagen, Copenhagen, Dinamarca
• Vinculado à bolsa: 15/13240-5 - Análise da decomposição da madeira em fragmento de mata atlântica: caracterização do substrato, estrutura da comunidade fúngica e o processo sucessional, BP.DR
• Assunto(s): Micologia Fungos Árvores Florestas tropicais Biologia computacional Sequenciamento de nova geração
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: community ecology | dead wood | fungal succession | Mycology | Next Generation Sequencing | Tropical forest | Micologia

Resumo

Nas florestas tropicais, a madeira é um dos principais componentes da biomassa e retém carbono na forma de moléculas de lignina, celulose e hemicelulose. Os fungos são organismos importantes que são responsáveis pela degradação destes compostos, a fim de libertar CO2 de volta à atmosfera. O presente estudo tem como objetivo identificar quais espécies de fungos ocorrem em três espécies de ramos de árvores durante dois anos de decomposição no solo de uma floresta tropical urbana em São Paulo (Brasil). Usando o sequenciamento de alto rendimento para identificar mudanças na diversidade de fungos e na estrutura da comunidade, propõe-se identificar os fungos nível de espécie, ou o mais próximo possível, recorrendo técnicas de bioinformática. Este estudo compreende três etapas em sua execução: (i) moer as amostras coletadas no projeto principal de doutorado e extrair DNA; (ii) sequenciar a região ITS2 usando a plataforma Illumina e (iii) análise de dados usando bioinformática. (AU)