Redes moleculares neuroimunológicas em doenças neurodegenerativas e infecciosas

• Processo: 18/10257-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2018
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2020
• Área de conhecimento: Interdisciplinar
• Acordo de Cooperação: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
• Pesquisador responsável: Helder Takashi Imoto Nakaya
• Beneficiário: Tiago Lubiana Alves
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Doenças transmissíveis Biologia computacional Transcriptoma Degeneração neural
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Doenças Infecciosas | Medicina de Redes | Neurodegeneração | neuroimune | Transcriptoma | Biologia de Sistemas Computacional

Resumo

Doenças neurodegenerativas e doenças causadas por agentes infecciosos são responsáveis por um grande ônus à saúde humana, tanto no Brasil quanto no mundo. Esses problemas tendem a aumentar nas próximas décadas, devido ao envelhecimento da população e ao aumento da resistência microbiana a antibióticos.O sistema imune periférico é capaz de modificar processos fisiológicos e patológicos do sistema nervoso central(SNC), tanto por células residentes do SNC quanto por leucócitos circulantes. Doenças que alteram o estado da imunidade periférica podem, então, influenciar no funcionamento do SNC. De forma interessante, há evidências epidemiológicas que doenças como periodontite crônica e infecção por Helicobacter pylori influenciam a incidência e a progressão da doença de Alzheimer. Além disso, devido ao grande número de doenças infecciosas e neurodegenerativas, há um grande número de possíveis combinações. Em países tropicais, com maior incidência de doenças negligenciadas, tais combinações adquirem importância ainda maior. Contudo, alterações neuro-imunes decorrentes de infecções periféricas são amplamente desconhecidas e não há estratégias terapêuticas para comorbidades específicas.Nesse projeto, utilizaremos uma estratégia de baixo-custo de curadoria e reanálise de dados transcriptômicos usando uma abordagem de medicina de redes para descobrir associações moleculares entre doenças infecciosas e neurodegenerativas. O protocolo de reanálise desenvolvido será aplicado à diversos conjuntos de dados imunológicos e neurológicos provenientes de pacientes com diversas doenças, incluindo as doenças neurológicas Alzheimer e Parkinson e as doenças infecciosas malária, tuberculose e zika. A partir desta reanálise, pretendemos detectar genes que interagem nas redes neuro-imunológicas das doenças de interesse, identificando candidatos para intervenções terapêuticas assim como genes chaves para modelos funcionais da patofisiologia das comorbidades.

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

ALVES, Tiago Lubiana. Detecção de populações em dados de sequenciamento de RNA de células individuais por meio de módulos de coexpressão. 2020. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Matemática e Estatística (IME/SBI) São Paulo.