Modelos genômicos não aditivos na avaliação de vacas leiteiras

• Processo: 19/03373-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2019
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2021
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Gerson Barreto Mourão
• Beneficiário: Fabrício Pilonetto
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Vacas leiteiras Qualidade do leite Gado Holandês Pecuária leiteira Frequência do gene Estudo de associação genômica ampla
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bovinos Leiteiros | dominância | Gwas | heterozigose genômica | imprinting genético | Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos

Resumo

As ferramentas genômicas possibilitaram grandes avanços nos estudos genéticos em animais de produção, desta forma, tornou-se possível identificar regiões do genoma e marcadores moleculares associados a características de importante impacto econômico na Pecuária. Tradicionalmente, as abordagens genômicas investigam os efeitos genéticos aditivos, no entanto, permanece incerta qual a contribuição dos efeitos não-aditivos na variância genética e fenotípica. Além disso, esses efeitos podem auxiliar na identificação de regiões do genoma que apresentam heterozigose vantajosa para características de interesse comercial. O objetivo deste estudo é estimar a heterozigose genômica individual em um estudo de associação genômica ampla (GWAS) para características de produção e qualidade do leite em bovinos da raça Holandesa, por meio de modelos genômicos não aditivos. Primeiramente, propõe-se trabalhar com simulação de dados, para identificar o modelo que melhor se ajusta para estudar o efeito da heterozigose nas predições genômicas. Para a simulação será utilizado o software QMSim e o pacote GenAbel para realizar a Run of heterozygosity (ROHet), com janelas de 50, 100 e 200 pb. Posteriormente, será aplicada a metodologia em dados reais, com informações fenotípicas de 5.981 vacas mensuradas entre os anos de 2012 a 2019. Para as análises genéticas serão utilizados dados genotípicos de 1.067 vacas, na qual 747 vacas foram genotipados em painel de baixa densidade e 389 vacas em painel de média densidade. Será proposto um GWAS adaptado para identificar a variação não-aditiva do fenótipo e possíveis QTLs e marcadores moleculares associados às regiões hetezigóticas. Este é um estudo complementar a outros realizados com apoio da FAPESP, na área do Melhoramento Genético em Bovinos Leiteiros e espera-se que este contribua para a expansão das fronteiras científicas em relação a estrutura genética de características importantes na Pecuária Leiteira e na investigação de abordagens genômicas alternativas para promover o progresso genético nas populações bovinas. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

PILONETTO, Fabrício. Modelos genômicos não aditivos na avaliação de vacas leiteiras. 2021. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.