Genomas dos fungos Trichoderma lentiforme e Trichoderma camerunense e análise da expressão gênica de tomateiros durante a interação com estes fungos

• Processo: 19/08627-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2019
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2021
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Pesquisador responsável: Ricardo Harakava
• Beneficiário: Carlos Alberto Albuquerque de Medeiros
• Instituição Sede: Instituto Biológico (IB). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/50334-3 - Plano de Desenvolvimento Institucional em Pesquisa (PDIp): modernização e adequação de unidades multiusuárias estratégicas do Instituto Biológico, AP.PDIP
• Assunto(s): Fitopatologia Genoma fúngico Fungos Trichoderma Expressão gênica Tomateiro Controle biológico Reação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa quantitativa (qRT-PCR) Análise de sequência de RNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Controle Biológico | expressão gênica | genoma de fungo | Promoção de Crescimento | Fitopatologia

Resumo

Fungos do gênero Trichoderma têm se destacado como agentes de controle biológico devido aos diversos mecanismos de ação (antagonismo, produção de substâncias antimicrobianas, parasitismo e capacidade de colonização) como também pela relação simbiótica que mantêm com as espécies vegetais. Em vista disto, houve um aprofundamento no estudo de sua biologia e de seu manejo dentro do sistema agrícola, havendo ainda uma demanda de conhecimentos genômicos e de taxonomia deste gênero de fungos. Recentemente, a reidentificação de 124 isolados de Trichoderma spp. da coleção da ULRBMA-IB (Unidade Laboratorial de Referência em Biologia Molecular Aplicada - Instituto Biológico), por meio de sequenciamento do gene do fator de elongação mostrou que a espécie predominante no solo de diferentes biomas do Estado de São Paulo é Trichoderma lentiforme (cerca de 38% do total de isolados). Esta é uma das quatorze espécies que foram recentemente desmembradas do complexo de espécies Trichoderma harzianum. Em estudos prévios na ULRBMA, diversos isolados de Trichoderma spp. desta coleção apresentaram grande potencial para a promoção de crescimento e controle de doenças de tomateiro, feijão, soja e pepino. Dois isolados que se destacaram foram 30/07 (T. lentiforme) e 19/17 (T. camerunense). Tendo em vista que nenhuma destas espécies teve ainda seu genoma sequenciado e visando uma melhor compreensão dos efeitos destes fungos sobre a planta hospedeira, propõe-se no presente estudo a obtenção dos genomas completos dos isolado 30/07 e 19/17 e a verificação do efeito da inoculação destes fungos sobre a expressão gênica de tomateiros. A obtenção dos genomas completos será realizada por meio de combinação das tecnologias Oxford Nanopore - MinION (sequências longas) e Illumina - HiSeq 2500 (sequências curtas). A análise dos transcriptomas das plantas inoculadas será realizada por RNAseq e sequenciador Illumina HiSeq 2500. A validação da expressão diferencial de genes a serem selecionados será realizada por qRT-PCR. Desta forma, espera-se obter uma melhor compreensão dos mecanismos de promoção de crescimento e proteção de plantas contra doenças de duas espécies nativas de Trichoderma. (AU)