Identificação de eventos de recombinação em bovinos Nelore

• Processo: 19/10123-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2019
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Lucia Galvão de Albuquerque
• Beneficiário: Patrícia Iana Schmidt
• Supervisor: Li Ma
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Maryland, College Park, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 18/17812-1 - Identificação de candidatos a haplótipos letais em bovinos Nelore, BP.MS
• Assunto(s): Recombinação genética
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Beef cattle | deleterious genes | females | low recombination | males | Genômica, Genética de populações

Resumo

A recombinação é um processo biológico fundamental no qual os materiais genéticos parentais são trocados durante a meiose do óvulo ou espermatozóide; Além disso, falhas na recombinação podem levar a um resultado potencialmente deletério, como aneuploidia. Os objetivos do presente estudo são identificar eventos de recombinação em bovinos Nelore machos e fêmeas e, através de análises funcionais, identificar genes candidatos deletérios localizados em regiões de baixa recombinação. Um total de 4.669 animais foram genotipados com um painel de alta densidade contendo 777.962 marcadores SNP e 4.094 com um painel contendo 70.000 marcadores, que serão imputados ao painel HD usando o software findhap.f90. As taxas de recombinação serão medidas por um método indireto usando pedigree. Para construir mapas de recombinação, a taxa de recombinação entre SNPs consecutivos como o número médio de cruzamentos por meiose será estimada atribuindo-se uniformemente um evento cruzado a todos os intervalos SNP entre dois SNPs informativos. Os dados de recombinação serão divididos por sexo para avaliar os padrões de recombinação em machos e fêmeas, e o teste qui-quadrado será aplicado para determinar se a proporção de eventos cruzados em uma faixa de SNP por meiose é diferente entre os sexos. Para identificar as variantes causais subjacentes às regiões de baixa recombinação, usaremos o software ENSEMBL. Escores SIFT serão usados para classificar mutações como deletérias ou tolerantes. Genes letais durante o desenvolvimento de todos os estágios da vida serão descritos e marcados como genes candidatos. Os resultados deste trabalho fornecerão informações sobre o mecanismo genético e a evolução da recombinação para a raça Nelore.