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Estudos computacionais de enzimas ativas em carboidratos e interações de celulose com compostos de matriz de paredes celulares de plantas

Processo: 19/17373-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de setembro de 2019
Vigência (Término): 31 de agosto de 2021
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Química - Físico-química
Pesquisador responsável:Munir Salomao Skaf
Beneficiário:Lucas Nascimento Trentin
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:13/08293-7 - CECC - Centro de Engenharia e Ciências Computacionais, AP.CEPID
Assunto(s):Química teórica   Celulose   Parede celular vegetal   Enzimas   Carboidratos   Simulação de dinâmica molecular

Resumo

O principal objetivo deste projeto é investigar as interações de celulose com compostos químicos encontrados na matriz da parede celular e também investigar as propriedades fundamentais das enzimas modificadoras de carboidratos usando métodos MD. Existem muitas abordagens distintas para investigar as interações químicas em simulações MD, com análise conformacional, estatísticas de ligação de hidrogênio e cálculos de energia livre sendo os métodos mais comuns. Diferentes modelos propostos serão usados em simulações para explicar a incerteza atual na estrutura da parede celular e enzimas e para obter insights sobre sua função biológica em estreita conexão com a análise experimental. Para interação celulose-hemicelulose, colaboramos de perto com o Prof. Paul Dupree, da Universidade de Cambridge. Para os estudos de enzima, contamos com nossos colegas da CCES e colaboradores do IFSC/USP e LNBR/CNPEM. (AU)