Estudos computacionais de enzimas ativas em carboidratos e interações de celulose com compostos de matriz de paredes celulares de plantas

• Processo: 19/17373-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2019
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Físico-química
• Pesquisador responsável: Munir Salomao Skaf
• Beneficiário: Lucas Nascimento Trentin
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/08293-7 - CECC - Centro de Engenharia e Ciências Computacionais, AP.CEPID
• Assunto(s): Química teórica Celulose Parede celular vegetal Enzimas Carboidratos Simulação de dinâmica molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioetanol | celulose | dinamica molecular de enzimas | Parede celular de plantas | química teórica

Resumo

O principal objetivo deste projeto é investigar as interações de celulose com compostos químicos encontrados na matriz da parede celular e também investigar as propriedades fundamentais das enzimas modificadoras de carboidratos usando métodos MD. Existem muitas abordagens distintas para investigar as interações químicas em simulações MD, com análise conformacional, estatísticas de ligação de hidrogênio e cálculos de energia livre sendo os métodos mais comuns. Diferentes modelos propostos serão usados em simulações para explicar a incerteza atual na estrutura da parede celular e enzimas e para obter insights sobre sua função biológica em estreita conexão com a análise experimental. Para interação celulose-hemicelulose, colaboramos de perto com o Prof. Paul Dupree, da Universidade de Cambridge. Para os estudos de enzima, contamos com nossos colegas da CCES e colaboradores do IFSC/USP e LNBR/CNPEM. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

TRENTIN, LUCAS N.; PEREIRA, CAROLINE S.; SILVEIRA, RODRIGO L.; HILL, STEFAN; SORIEUL, MATHIAS; SKAF, MUNIR S.. Nanoscale Wetting of Crystalline Cellulose. Biomacromolecules, v. 22, n. 10, p. 4251-4261, OCT 11 2021. (19/17373-0, 13/08293-7, 14/10448-1, 15/25031-1)