Interação de microrganismos e hospedeiros humanos associados ao desfecho clínico de pacientes com doenças infecciosas

• Processo: 20/05284-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2020
• Data de Término da vigência: 29 de março de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Imunologia - Imunologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Helder Takashi Imoto Nakaya
• Beneficiário: Ícaro Maia Santos de Castro
• Instituição Sede: Centro de Inovação da USP (INOVA). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/14933-2 - Biologia integrativa aplicada à saúde humana, AP.JP2
• Bolsa(s) vinculada(s): 23/03951-8 - Um pipeline de metatranscriptômica para investigar interações micróbio-hospedeiro em amostras de baixa biomassa: um estudo de caso em biópsias líquidas de pacientes com câncer de próstata, BE.EP.DD
• Assunto(s): Biologia computacional Biologia de sistemas Doenças transmissíveis Sistema imune Expressão gênica Resposta imune Microbiota Análise de sequência de RNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biologia de sistemas | Doenças Infecciosas | expressão gênica | Imunologia | metatranscriptômica | Microbioma | Biologia Computacional

Resumo

Nos últimos anos, a importância de estudar as comunidades microbianas presentes no intestino humano tem sido amplamente elucidada. Essas comunidades microbianas não apenas contribuem para a defesa local dos hospedeiros contra infecções, mas também modulam as respostas do sistema imunológico em diferentes locais e tecidos. O microbioma humano é dinâmico e, sob condições que comprometem a barreira de defesa do hospedeiro, algumas espécies desses microrganismos podem invadir tecidos e causar infecções virais, bacterianas e fúngicas. O seguinte estudo tem como objetivo investigar o impacto da expressão gênica e do microbioma do hospedeiro na resposta imunológica de doenças infecciosas. Por meio de dados públicos de RNA-seq de sangue total, pretendemos realizar uma abordagem multi-ômica utilizando a biologia de sistemas para elucidar como a interação do microbioma e do sistema imunológico do hospedeiro podem estar associadas ao desfecho clínico dos pacientes acometidos por doenças infecciosas. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

AQUIME GONCALVES, ANDRE NICOLAU; MASO, VANESSA ESCOLANO; SANTOS DE CASTRO, ICARO MAIA; VASCONCELOS, AMANDA PEREIRA; TOMIO OGAVA, RODRIGO LUIZ; NAKAYA, HELDER, I. High-Throughput Transcriptome Analysis for Investigating Host-Pathogen Interactions. JOVE-JOURNAL OF VISUALIZED EXPERIMENTS, v. N/A, n. 181, p. 22-pg., 2022-03-01. (18/14933-2, 13/08216-2, 19/13880-5, 19/16418-0, 19/27146-1, 12/19278-6, 20/05284-0, 17/50137-3, 18/21934-5)