Bioinformática integrativa de Quillaja brasiliensis: análise do transcriptoma e identificação de genes relacionados a síntese de saponinas triterpênicas

• Processo: 21/03947-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2021
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2021
• Área de conhecimento: Interdisciplinar
• Acordo de Cooperação: CONFAP - Conselho Nacional das Fundações Estaduais de Amparo à Pesquisa
• Pesquisador responsável: Douglas Silva Domingues
• Beneficiário: Alan Péricles Rodrigues Lorenzetti
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/15477-3 - Moléculas sinalizadoras na modulação do transcriptoma, fluxo metabólico e produção de saponinas triterpênicas imunoadjuvantes em Quillaja brasiliensis Mart. (Quillajaceae), AP.R
• Assunto(s): Biologia computacional Transcriptômica Saponinas Análise de dados
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia Computacional | recursos de transcriptoma | RNA-seq | terpenóides | Bioinformática

Resumo

Quillaja brasiliensis é uma espécie arbórea nativa do sul do Brasil, conhecida popularmente como pau-sabão, que produz saponinas triterpênicas bioativas. O projeto visa um estudo molecular de genes candidatos na produção de saponinas bioativas. O bolsista participa das etapas associadas a bioinformática, atuando nas etapas de análise de dados transcriptômicos e defluxo metabólico. Atua ainda na configuração e manutenção de infraestrutura de hardware e softwares em plataforma Linux até etapas mais específicas da análise bioinformática de sequências. Para isso, emprega técnicas de biologia computacional, reconhecimento de padrões e aprendizagem de máquina para definir um conjunto de genes de referência de Quillaja brasiliensis. Dessa forma, espera-se melhor compreender a regulação de biossíntese de saponinas triterpênicas de alto valor comercial em cultivos celulares de Q. brasiliensis e avaliar sua viabilidade como fonte alternativa e/ou complementar destes produtos naturais e, a longo prazo, dar subsídios à produção biotecnológica em sistemas heterólogos. (AU)