Levantamento de vírus em amostras metagenômicas de morcegos amazônicos

• Processo: 21/05209-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2021
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2022
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Arthur Gruber
• Beneficiário: Nayara Almeida Amed
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Virologia molecular Viroma Chiroptera Morcegos Amazônia Filogenia molecular Genomas Modelo oculto de Markov
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Filogenia molecular | HMMs de perfil | Levantamento de vírus | Morcegos | Virologia Molecular | Virologia

Resumo

A ordem dos quirópteros (Chiroptera) é a segunda maior entre os mamíferos do planeta, após os roedores, possuindo mais de 1.300 espécies. O Brasil possui cerca de 15% de toda a diversidade de espécies de morcegos do planeta, com boa parte das populações presentes no bioma da Amazônia. Morcegos podem ser hospedeiros de uma ampla variedade de vírus e funcionar como reservatórios para a espécie humana, como foi o caso de uma série de importantes infecções humanas como a raiva, SARS, MERS e, mais recentemente, COVID-19. Levantamentos do viromas de quirópteros revelaram a presença de importantes famílias virais como Adenoviridae, Coronaviridae, Parvoviridae, Paramyxoviridae, Herpesviridae, Arenaviridae e Retroviridae, entre outras. No presente projeto, pretende-se fazer o levantamento do viroma de amostras de diferentes tecidos de Natalus macrourus, Lonchorhina aurita e Furipterus horrens, espécies de morcegos insetívoros que habitam cavidades na região da Serra dos Carajás PA. Para isso, HMMs de perfil representando todas as famílias de vírus de eucariotos serão usados em buscas de similaridade contra sequências metagenômicas dos morcegos. Os modelos que identificarem leituras positivas serão usados como sementes para montagens progressivas alvo-específicas. Os genomas virais reconstruídos serão submetidos a um pipeline de anotação funcional automática. Finalmente, sequências proteicas de marcadores moleculares virais serão usadas para estudos de reconstrução filogenética dos principais vírus detectados. (AU)