Métodos para mapeamento de QTL através de marcadores tipo SNP em dados familiares: uma revisão

• Processo: 21/06131-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2021
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2022
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Probabilidade e Estatística - Estatística
• Pesquisador responsável: Daiane Aparecida Zuanetti
• Beneficiário: Lara Midena João
• Instituição Sede: Centro de Ciências Exatas e de Tecnologia (CCET). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
• Assunto(s): Marcadores genéticos Mapeamento Modelos lineares mistos Modelos de regressão
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Dados familiares GAW17 | modelos mistos | Seleção de variáveis | Teste de significância | Seleção de variáveis e modelos de regressão

Resumo

O mapeamento de regiões no genoma associadas a traços quantitativos (QTLs) através de marcadores genéticos do tipo SNP tem sido um dos problemas centrais em Genética e Biologia Molecular e vários métodos de detecção e identificação de QTLs tem sido proposto na literatura. Neste trabalho, vamos pesquisar, estudar e descrever os principais métodos que tem sido utilizado para esse fim em dados familiares. Metodologias que analisam amostras em família são geralmente mais complexas do que metodologias que assumem independência entre os indivíduos, pois elas precisam considerar e descrever a associação genética que existe entre indivíduos da mesma família, além de identificar e selecionar os SNPs mais relevantes para explicar a variabilidade do traço quantitativo em estudo. Também vamos destacar suas vantagens e desvantagens e elencar os algoritmos que já estão implementados e disponíveis para utilização. O desempenho das diferentes metodologias estudadas será comparado via análise dos dados familiares GAW17.(AU)