Vigilância genômica de variantes de preocupação do Sars-CoV-2 no município de São Paulo

• Processo: 21/09969-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2021
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2022
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biologia Geral
• Acordo de Cooperação: MRC, UKRI ; Newton Fund, com FAPESP como instituição parceira no Brasil
• Pesquisador responsável: Ester Cerdeira Sabino
• Beneficiário: Marissa da Silva Lima
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/14389-0 - Centro Conjunto Brasil-Reino Unido para Descoberta, Diagnóstico, Genômica e Epidemiologia de Arbovírus (CADDE), AP.TEM
• Assunto(s): Virologia Biologia molecular SARS-CoV-2 Variantes genéticas Técnicas de genotipagem
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Beiologia Molecular | Virologia | Biologia Molecular

Resumo

A emergência e disseminação de "variantes de preocupação" (do inglês, variants of concern [VOCs]) do SARS-CoV-2 é um fenômeno de relevância epidemiológica e clínica. Não apenas estas variantes podem ter maior transmissibilidade e virulência, mas a mutação em antígenos estratégicos para imunidade pode determinar eficácia reduzida de estratégias vacinais. A vigilância ativa, sensível e oportuna de VOCs em uma área urbana de alta densidade populacional permite não só identificar padrões de emergência como regionalizar medidas de controle. Propomos, portanto, a genotipagem por sequenciamento de genoma total de amostra representativa do SARS-CoV-2 distribuída proporcionalmente pelas cinco Coordenadorias Regionais de Saúde do Município de São Paulo e coletadas sequencialmente em semanas epidemiológicas. A amostragem semanal estimada é de 96 isolados selecionados aleatoriamente seguindo os princípios expostos acima. Este plano de trabalho está vinculado ao projeto "Vigilância, análise temporal e epidemiologia espacial de variantes de preocupação do SARS-CoV-2 no município de São Paulo" para identificar padrões de emergência e disseminação de VOCs. (AU)