Identificação de ligantes das DUSPs mitocondriais através de ferramentas bioinformáticas

• Processo: 21/10474-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2021
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
• Pesquisador responsável: Luciana Elena de Souza Fraga Machado
• Beneficiário: Luca Paulino Otvos
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/02605-3 - Modulação estrutural e funcional das proteínas fosfatases mitocondriais pelo metabolismo redox e as implicações na biologia celular, AP.JP
• Assunto(s): Biologia computacional Mitocôndrias Substratos Análise in silico
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Dusp | mitocôndria | Proteínas fosfatases | Ptpmt1 | Substratos | Estrutura e função de proteínas

Resumo

As proteínas quinases e fosfatases são atores principais em diversas vias de sinalização e funções celulares, sendo responsáveis pelo equilíbrio na ativação e produção de moléculas pela fosforilação e desfosforilação de seus substratos. Diferentes trabalhos têm mostrado a importância das proteínas fosfatases localizadas em sub-compartimentos da mitocôndria. Dentre elas, as DUSPs são proteínas tirosina fosfatase capazes de desfosforilar seus alvos em resíduos de serina, treonina e tirosina. Quatro DUSPs foram identificadas na mitocôndria: PTPMT1 (DUSP23), DUSP18, DUSP21 e DUSP26. Até o momento, poucas ou nenhuma função mitocondrial foi desvendada para essas DUSPs. Sendo assim, o objetivo desse trabalho será a investigação por seus ligantes dentro da mitocôndria. Para isso, realizaremos uma busca por parceiros das DUSPs mitocondriais in silico e analisaremos essas interações para identificarmos as vias de sinalização celular que essas DUSPs estão envolvidas. Finalmente iremos identificar as regiões de interação entre a PTPMT1 e dois ligantes. Esses resultados permitirão ampliar o panorama de conhecimento sobre as DUSPs mitocondriais, além de orientar futuros trabalhos que busquem aprofundar a caracterização das interações e funções dessas fosfatases. (AU)