Desenvolvimento de um molde de aplicações web para criação e administração de bases de dados de produtos naturais da biodiversidade local

• Processo: 21/14237-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Vigência (Início): 01 de março de 2022
• Vigência (Término): 30 de abril de 2023
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Farmácia - Farmacognosia
• Pesquisador responsável: Ricardo Roberto da Silva
• Beneficiário: Ana Carolina Lunardello Coelho
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/18922-2 - Desenvolvimento de uma plataforma computacional modular extensível para análises de experimentos de metabolômica e metagenômica: inovando com a descoberta de novas atividades enzimáticas e produtos naturais de interesse farmacêutico derivados, AP.BTA.JP
• Assunto(s): Biologia computacional Mineração de texto Quimioinformática Desenvolvimento web
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Desenvolvimento Web | Mineração de Textos | quimioinformática | Bioinformática

Resumo

A criação de ferramentas inovadoras para o estudo de produtos naturais é estratégica para o Brasil, uma vez que existem estimativas de que 64% de todos os medicamentos atualmente registrados tenham um produto natural envolvido no seu desenvolvimento e de que a biodiversidade brasileira corresponda a cerca de 20% da biodiversidade mundial. O projeto de iniciação científica 19/18378-6, desenvolvido pela estudante Ana C. L. Coelho, gerou a ferramenta de mineração de produtos naturais, NPMINE, anexa à presente proposta. O artigo científico, em redação, demonstra o potencial da catalogação de produtos naturais, e demonstrou a necessidade da criação de uma ferramenta que permita aos usuários criar, pesquisar, editar e apagar objetos catalogados (do inglês: CRUD - Create, Read, Update, Delete). O Laboratório de Quimio-Biologia Computacional desenvolveu (Projeto 20/10351-9) e desenvolve (Projeto 21/03368-5) projetos de criação de aplicações web (http://ccbl.fcfrp.usp.br/ccbl/training.html), gerando uma biblioteca de módulos de código que pode ser utilizada para suportar o desenvolvimento de projetos mais sofisticados (https://github.com/computational-chemical-biology/flask_tutorial). O projeto Jovem Pesquisador (Projeto 17/18922-2) integra o desenho racional de aplicações web ao planejamento experimental e análise de dados de metabolômica (Proposta 21/10401-9) e metagenômica (Proposta 21/08235-3), de tal forma que a expansão da biblioteca de módulos do laboratório tem o potencial de permitir a utilização das estruturas químicas mineradas pela ferramenta NPMINE, assim como propiciar a integração dos projetos de metabolômica e metagenômica pela criação de interfaces que permitam ao usuário contextualizar os dados coletados em amostras de comunidades microbianas de ambientes marinhos, descritas na presente proposta. Diante do exposto, o presente projeto propõe a expansão da biblioteca de módulos de aplicações web criando uma ferramenta CRUD para a exploração de produtos naturais obtidos da literatura científica.