Desenvolvimento de um protocolo para estudo de associação de varredura genômica a ser aplicado na investigação de epilepsia do lobo temporal mesial em brasileiros miscigenados

• Processo: 21/15030-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 29 de agosto de 2022
• Data de Término da vigência: 28 de agosto de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Iscia Teresinha Lopes Cendes
• Beneficiário: Estela Maria Bruxel
• Supervisor: Elizabeth Atkinson
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Baylor College of Medicine, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 18/03254-7 - ESTUDO DE ASSOCIAÇÃO DE VARREDURA GENÔMICA BASEADA NA EXPRESSÃO GÊNICA (eGWAS) EM EPILEPSIA DE LOBO TEMPORAL MESIAL, BP.PD
• Assunto(s): Biologia computacional Genômica Estudo de associação genômica ampla Epilepsia do lobo temporal
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | epilepsia do lobo temporal mesial | Genômica | Gwas | Populações Miscigenadas | bioinformática

Resumo

A epilepsia é um distúrbio neurológico caracterizado pela predisposição permanente do cérebro para gerar crises epilépticas espontâneas. A epilepsia do lobo temporal mesial (ELTM) é a forma mais frequente de epilepsia focal em adultos, e a esclerose hipocampal (EH) é uma característica histopatológica comum em pacientes com ELTM. Os estudos de associação de varredura genômica (GWAS) têm sido amplamente usados para identificar genes envolvidos em distúrbios complexos. Embora o número de GWAS em populações miscigenadas tenha aumentado nos últimos anos, ainda há uma lacuna notável em comparação com outras populações. A miscigenação populacional impõe desafios adicionais para GWAS; no entanto, ao aplicar protocolos específicos, a miscigenação também pode ser vantajosa no contexto de estudos genéticos. Além disso, embora existam vários estudos de GWAS em epilepsia, os resultados em ELTM têm sido decepcionantes. Assim, este projeto visa desenvolver e aplicar um protocolo GWAS adequado ao estudo das populações miscigenadas brasileiras e aplicá-lo a uma grande coorte de pacientes com ELTM e EH identificados em diferentes centros de epilepsia no Brasil e em Portugal. Todos os pacientes preencheram os critérios diagnósticos para ELTM e EH propostos pela International League Against Epilepsy. Até o momento, participam do estudo 525 pacientes e 480 controles. Os controles foram pareados etnicamente com os pacientes e selecionados nos mesmos centros clínicos. Usamos o array Affymetrix 6.0 para genotipagem de SNPs. Usaremos o software e o método estatístico Tractor, que foi recentemente desenvolvido pela supervisora do exterior, Dra. Elizabeth Atkinson, para análise de associação. Esperamos desenvolver um pipeline de análises sob medida para a população brasileira, abordando assim questões importantes e ainda sem resposta sobre demografia populacional, adaptação e seleção natural. A abordagem descrita permitirá o estudo de características complexas em indivíduos com diferentes proporções de mistura encontrados em nosso país e pode ser aplicada ao estudo de outros transtornos complexos. (AU)