Impactos da inclusão de corridas de homozigosidade em processos de acasalamento dirigido em uma população simulada de bovinos de corte

• Processo: 21/11156-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2022
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Ricardo Vieira Ventura
• Beneficiário: Alana Selli
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Melhoramento animal Seleção genômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Estratégia de seleção | melhoramento animal | selecao genomica | Melhoramento animal

Resumo

Acasalamentos dirigidos podem ser conduzidos em programas de melhoramento a fim de promover a redução da endogamia sem comprometer o ganho genético de uma população. Entre os métodos utilizados para a caracterização de autozigose, destaca-se o uso das corridas de homozigosidade (ROH), que correspondem a cópias idênticas de haplótipos herdadas de um mesmo indivíduo. Este método permite a quantificação do coeficiente de endogamia genômico específico para cada indivíduo e a localização dos loci autozigotos no genoma. Desta forma, a inclusão das ROH pode oferecer um maior grau de detalhamento para o direcionamento de acasalamentos em programas de melhoramento animal, potencializando o ganho genético e ao mesmo tempo a redução do coeficiente de endogamia da população. Os objetivos deste projeto são (i) aplicar diferentes estratégias de seleção em relação aos perfis de ROH em uma população simulada, (ii) investigar o impacto de tais estratégias sob o ganho genético e parâmetros relacionados à variabilidade genética da população, e (iii) desenvolver uma interface que permita o acompanhamento de tal processo de seleção e a observação de seus impactos sobre cada componente do sistema. O programa AlphaSimR será utilizado para a simulação de uma população de bovinos de corte, com duas características quantitativas com herdabilidades distintas (h2 = 0.10 ou 0.30). Algumas gerações serão selecionadas por valor genético estimado e diferentes estratégias envolvendo corridas de homozigosidade, e posteriormente serão analisados alguns parâmetros relativos ao ganho genético e nível de endogamia da população, utilizando-se ferramentas computacionais que permitem que o usuário navegue ao longo das gerações e visualize diversos componentes do sistema, como genótipos, fenótipos, grupamentos genéticos, padrões de corridas de homozigosidade, desequilíbrio de ligação, entre outros.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

PAULA DE FREITAS CURTI; ALANA SELLI; DIÓGENES LODI PINTO; ALEXANDRE MERLOS-RUIZ; JULIO CESAR DE CARVALHO BALIEIRO; RICARDO VIEIRA VENTURA. Applications of livestock monitoring devices and machine learning algorithms in animal production and reproduction: an overview. Animal Reproduction, v. 20, n. 2, 2023-08-28. (21/11156-8, 16/19514-2, 21/03101-9)

PINTO, DIOGENES LODI; SELLI, ALANA; TULPAN, DAN; ANDRIETTA, LUCAS TASSONI; GARBOSSA, POLLYANA LEITE MATIOLI; VANDER VOORT, GORDON; MUNRO, JASPER; MCMORRIS, MIKE; ALVES, ANDERSON ANTONIO CARVALHO; CARVALHEIRO, ROBERTO; et al. Image feature extraction via local binary patterns for marbling score classification in beef cattle using tree-based algorithms. LIVESTOCK SCIENCE, v. 267, p. 10-pg., 2023-01-06. (20/04461-6, 16/19514-2, 21/11156-8)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

SELLI, Alana. Impactos da inclusão de corridas de homozigosidade em processos de acasalamento dirigido em uma população simulada de bovinos de corte. 2024. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ/SBD) Pirassununga.