Estudos sobre a a função de sistemas de secreção do tipo IV bactericidas de espécies da ordem Xanthomonadales

• Processo: 22/02828-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2022
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Bioquímica de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Shaker Chuck Farah
• Beneficiário: Michella Alessandra Brescia Reátegui
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/17303-7 - Estrutura e função de sistemas de secreção bacterianas, AP.TEM
• Assunto(s): Macromolécula Biologia estrutural Enzimologia Microbiologia Xanthomonas Sistemas de secreção tipo IV
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia Estrutural | Competição bacteriana | Enzimologia | Microbiologia | Type IV secretion system | Xanthomonas | Bioquímica de Macromoléculas

Resumo

X. citri é apenas uma das centenas de espécies do gênero Xanthomonas e mais gêneros da ordem Xanthomonadales que inclui importantes espécies ambientais do solo, água e ambientes vegetais. À medida que mais e mais genomas de bactérias dessas espécies são sequenciados a cada ano, estamos lentamente construindo uma imagem mais clara sobre a extensão em que homólogos do T4SS bactericida de X. citri são encontrados em outros organismos. Até agora, identificamos sistemas homólogos em espécies de outros gêneros de Xanthomonadales, incluindo Stenotrophomonas, Lysobacter, Pseudoxanthomonas, Luteimonas, Luteibacter, Dyella e Rhodanobacter. Curiosamente, parece que este sistema não está restrito à classe Gammaproteiobacteria, uma vez que sistemas homólogos também podem ser encontrados em algumas Neisseiria spp e Burkholdeiria spp da classe betaproteobacteria. Estamos muito interessados em explorar a estrutura e função desses sistemas homólogos. Neste estudo, planejamos estender essa caracterização para algumas outras espécies dos gêneros listados acima. Essa caracterização inclui I) uma análise bioinformática dos bancos de dados para obter cepas bacterianas específicas que carregam um T4SS aparentemente funcional de outros grupos de pesquisa ou coleções microbiológicas; II) a produção de nocautes de T4SS nessas espécies bacterianas; III) a criação de bactérias ensaios de morte usando as cepas de tipo selvagem e mutantes e, finalmente; IV) a expressão dos complexos centrais desses T4SSs homólogos para análise estrutural usando Cryo-EM. (AU)