Busca por moléculas bioativas com ação inibitória na proteína não estrutural nsp13 de sars-cov-2, utilizando triagens enzimáticas e fragment screening

• Processo: 22/11106-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2022
• Data de Término da vigência: 12 de fevereiro de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Glaucius Oliva
• Beneficiário: Luana Galvão Morão
• Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/07600-3 - CIBFar - Centro de Inovação em Biodiversidade e Fármacos, AP.CEPID
• Assunto(s): SARS-CoV-2
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioactive molecules | Enzymatic screening | fragment screening | Non- structural protein | Nsp13 | SARS-CoV-2 | Biologia estrutural e descoberta de fármacos

Resumo

O surgimento de um novo coronavírus, em 2019, gerou uma pandemia que perdura até o momento,por isso a busca por candidatos à novos medicamentos antivirais contra o SARS-CoV-2 tornou-se prioritária. A proteína não estrutural Nsp13, codificada no genoma viral, é uma enzima com atividade helicase dependente da hidrólise de ATP, sendo essencial para a replicação viral e, portanto, um alvo atrativo no âmbito da estratégia de planejamento de fármacos. Neste contexto a presente proposta vem dar continuidade ao trabalho iniciado pela candidata como pós-doc (Proc. FAPESP 2021/06036-3) com bolsa BCO concedida em projeto aprovado na chamada COVID-19 da FAPESP (Proc.FAPESP 2020/04602-9), o qual teve como resultados a descrição da clonagem, superexpressão e purificação da enzima Nsp13 em um sistema de expressão baseado em E.coli. A pós-doutora LuanaG. Morão, contemplada com a bolsa do projeto citado, também estabeleceu ensaios biofísicos ebioquímicos para triagem de coleções de compostos, focando nas atividades atpase e helicase deNsp13. Sendo assim, a presente proposta visa a investigação de coleções de moléculas naturais esintéticas do CIBFar/CEPID-FAPESP e bibliotecas de compostos da organização internacional Medicines for Malaria Ventures (MMV), bem como outras coleções provenientes de colaboradores externos do CIBFar. O método de Planejamento de Ligantes Baseado na Estrutura dos Alvos (SBDD) também é outra estratégia que será executada nesta proposta. Dessa forma a obtenção da estruturacristalográfica para realização de soaking e outras avaliações acerca da afinidade de ligação entre compostos biativos com Nsp13 serão investigados e explorados. Compostos que apresentem atividade inibitória promissora sobre a Nsp13 serão avaliados em modelos in vitro de infecção celular pelo SARS-CoV-2 e serão otimizados quanto a suas propriedades de potência e seletividade, visando obter moléculas candidatas a estudos pré-clínicos avançados. Esse projeto está vinculado ao CIBFar - Centro de Inovação em Biodiversidade e Fármacos - CIBFar/CEPID (Proc. 2013/07600-3).