Treinamento técnico em sequenciamento de nova geração

• Processo: 22/15274-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2023
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Iscia Teresinha Lopes Cendes
• Beneficiário: Laiz Luiza Miranda de Oliveira
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/07559-3 - Instituto Brasileiro de Neurociência e Neurotecnologia - BRAINN, AP.CEPID
• Assunto(s): Neurociências
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Epilepsias | Genética das epilepsias | Neurosciências

Resumo

Neste projeto o estagiário realizará as seguintes tarefas:- Verificação de qualidade do DNA. A integridade do DNA extraído será testada por eletroforese em gel de agarose 1% para verificar o grau de fragmentação da amostra. Os padrões de pureza e concentração serão medidos com um espectrofotômetro BiTek Epoch e os valores de absorbância 260 / 280nm entre 1,8 e 2,0 serão considerados ideais para a construção das bibliotecas com o kit SureSelectXT Human All Exons (Agilent Technologies). Este kit é otimizado para 3 ¼g de DNA genômico total que será quantificado usando o sistema Qubit.-Preparação de bibliotecas de DNA: A preparação de bibliotecas genômicas para todos os indivíduos seguirá o protocolo recomendado pelo fabricante usando o kit SureSelectXT Target Enrichment System for Illumina Paired-End Sequencing Library (Agilent Technologies) que é composto pelas etapas descritas abaixo.e) Fragmentação do DNAii) Verificação da qualidade do DNA fragmentadoiii) Reparação de extremidadesiv) Ampliação das bibliotecasv) Verificação da qualidade da bibliotecavi) Hibridaçãovii) Captura por hibridizaçãoviii) Adição de índice para amplificaçãoix) Agrupamento de amostras para sequenciamento e preparação de amostrasx) Sequenciamento