Organização do mitogenoma e diversidade de cestoides proteocefalídeos (Cestoda) revelados por genome skimming

• Processo: 23/00714-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2023
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Recursos Pesqueiros de Águas Interiores
• Pesquisador responsável: Reinaldo José da Silva
• Beneficiário: Philippe Vieira Alves
• Supervisor: Daniel Andrew Janies
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of North Carolina at Charlotte (UNCC), Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 21/12593-2 - Proteocefalídeos (Eucestoda: Onchoproteocephalidea) parasitos de peixes do Alto Paraná: diversidade, relações filogenéticas e associações parasito-hospedeiro, BP.PD
• Assunto(s): Parasitologia veterinária Peixes Cestoda Biologia evolutiva
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: annotation pipelines | Assembling | Complete mtDNA | Evolutionary interrelationships | Fish tapeworms | Proteocephalidae | Total evidence framework | Parasitologia de Peixes

Resumo

A diversificação animal tem intrigado os biólogos evolucionistas ao longo de décadas e ainda é uma questão de intenso debate. No entanto, a maioria das discussões está relacionada a táxons de vida livre. Ao mesmo tempo, a vida dentro de outros organismos, como os cestoides proteocefalídeos (Eucestoda, Onchoproteocephalidea) que parasitam peixes, tem sido frequentemente negligenciada. Embora os proteocefalídeos representem a maior radiação de cestoides em peixes ósseos do planeta (particularmente em bagres sul-americanos), a evolução do grupo permanece um mistério devido à falta de resolução suficiente em reconstruções filogenéticas recentes. A presente proposta atende a esta demanda ao submeter espécimes de cestoides proteocefalídeos, fixados em etanol e depositados em coleções helmintológicas, a técnicas de sequenciamento de DNA de alto rendimento. Os protocolos otimizados de biologia molecular e bioinformática revelarão a organização do mitogenoma e a diversidade de sequencias de proteocefalídeos em peixes. Além disso, análises evolutivas modernas e abrangentes, empregadas em sequencias moleculares publicamente disponíveis e dados inéditos, responderão a questões de longa data sobre a evolução dos proteocefalídeos. Ademais, o projeto originará uma estrutura metodológica e conceitual para preencher a lacuna entre a taxonomia de platelmintos parasitos e as abordagens de ponta em genômica e bioinformática. Desta forma, a metodologia desenvolvida como resultado desta proposta será adicionada ao conjunto de análises moleculares eficientes em termos de recursos que prometem tornar os biorrepositórios de museus mais prontamente disponíveis para a pesquisa biomédica. (AU)