Bolsa de Treinamento Técnico (TT-5): Enfrentando os Desafios Computacionais de uma Abordagem Multidisciplinar para o Estudo da Diversificação de Anfíbios

• Processo: 23/01358-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia - Taxonomia dos Grupos Recentes
• Pesquisador responsável: Taran Grant
• Beneficiário: Esdras Matheus Gomes da Silva
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/15425-0 - Uma abordagem multidisciplinar para o estudo da diversificação dos anfíbios: fase 2, AP.JP2
• Assunto(s): Sequenciamento de nova geração
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: de novo assembly | hDNA | mapeamento e anotação genômica | Ngs | organismos não-modelos | Sistemática filogenética e bioinformática

Resumo

Avanços teóricos e empíricos nos últimos 50 anos revolucionaram o conhecimento científico dos anfíbios. Com este novo conhecimento, surge uma grande variedade de novas perguntas de pesquisa que exigem a integração de campos científicos independentes. De acordo com os objetivos do programa de Jovens Pesquisadores, pretendo estabelecer uma nova linha de pesquisa que combina novas tecnologias e abordagens inovadoras de diversos campos para investigar a diversificação dos anfíbios em várias escalas. Em pesquisas sobre a sistemática de anfíbios, serão realizadas saídas de campo no Brasil e na Colômbia e analisadas evidências fenotípicas e moleculares. Usando o sequenciamento de próxima geração, serão gerados 30 genomas completos, os quais serão usados para estudar a estrutura e função genômica e desenvolver primers universais para sequenciamento de regiões específicas para análise filogenética. A pele dos anfíbios possui um vasto arsenal de substâncias defensivas. Será investigada a evolução e ecologia da diversidade de alcalóides defensivos dos dendrobatídeos e do gênero bufonídeo Melanophryniscus. As invasões biológicas são uma das maiores ameaças à biodiversidade e também uma oportunidade única para estudar processos evolutivos e ecológicos. A distribuição da espécie invasora Lithobates catesbeianus, a rã-touro, tem aumentado muito no Brasil. Será usada a radio-telemetria para seguir os movimentos de indivíduos a fim de entender melhor os padrões e distâncias de movimento das populações invasoras e serão simuladas invasões acústicas para estudar o impacto da invasão desta espécie sobre a biodiversidade nativa.