Estudo de padrões diferenciais de expressão gênica em indivíduos brasileiros mistos usando sequenciamento de RNA unicelular (scRNA-seq) e análise genômica

• Processo: 23/01039-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2023
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Iscia Teresinha Lopes Cendes
• Beneficiário: Thais Crippa de Oliveira
• Supervisor: Gosia Trynka
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Wellcome Sanger Institute (WSI), Inglaterra
• Vinculado à bolsa: 21/01017-0 - Análise multiômica em Neurociências, BP.PD
• Assunto(s): Genética médica Genômica Diversidade genética Ancestralidade América Latina
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Admixed populations | ancestry | Genomic | Mtle+Hs | scRNAseq | Genética Humana

Resumo

A ancestralidade genética tem sido reconhecida como um tópico chave na genética de populações. Sabendo disso, a diversidade genética das populações latino-americanas deriva das contribuições genéticas significativas das populações nativas americanas, europeias e africanas subsaarianas. Esses eventos históricos resultaram na presença de blocos ancestrais heterogêneos em populações miscigenadas. No entanto, como as populações mestiças da América Latina têm diferentes proporções de ancestralidade genética, usar essas populações como referência para as populações brasileiras pode levar a resultados e interpretações espúrias. Além disso, devido ao tamanho e ancestralidade heterogênea da população brasileira, é provável que diferentes proporções ancestrais ocorram em diferentes regiões geográficas do país devido a eventos demográficos. Além disso, a ancestralidade demonstrou ser um fator influente que deve ser modelado ou controlado para estudos ômicos, incluindo estudos do transcriptoma humano. Neste projeto, será avaliado o efeito funcional de diferentes blocos haplotípicos dentro de cada indivíduo, usando uma estrutura computacional para identificação e classificação de haplótipos ancestrais e, com os dados da célula scRNA-seq PBMC integrados com os dados de genotipagem de 20-30 indivíduos brasileiros, serão mapeados os efeitos de variantes genéticas na expressão gênica em células do sistema imune. Portanto, esses dados podem ser usados para entender melhor a influência que os haplótipos ancestrais podem ter na expressão gênica e, eventualmente, nos fenótipos da doença. (AU)