Avaliação do papel da aconitase na regulação de genes de síntese de ferro-enxofre em Caulobacter crescentus

• Processo: 23/06833-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2023
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Marilis Do Valle Marques
• Beneficiário: João Pedro de Carvalho Pereira
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/10577-0 - Centro de Pesquisa em Biologia de Bactérias e Bacteriófagos (CEPID B3), AP.CEPID
• Assunto(s): Regulação da expressão gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Aconitase | Grupos Ferro-Enxofre | Regulação pós-transcricional | Regulação genica

Resumo

A aconitase é uma proteína mais conhecida por sua ação enzimática de catalisação da reação de conversão de citrato para isocitrato no Ciclo de Krebs, quando ligada a um grupo FeS. Além disso, em outros organismos, como em Escherichia coli, essa proteína na forma Apo (sem o grupo FeS) também possui a capacidade de ligar RNA alterando sua meia-vida e a tradução. Entretanto, em C. crescentus (uma alfaproteobactéria muito utilizada como organismo modelo para estudo de diferenciação celular em procariontes), esta proteína faz parte do degradossomo de RNA, importante estrutura de regulação de expressão gênica global em procariontes. Dessa forma, este projeto pretende avaliar se a aconitase de C. crescentus pode-se ligar e com quais RNAs, e como ela interfere na regulação desses RNAs. Para esta finalidade, será realizada a clonagem do gene da aconitase com um tag FLAG em C. crescentus, purificação da proteína com os RNAs ligantes, identificação destes por RNA-seq e observação das mudanças na estabilidade desses RNAs por RT-qPCR em culturas com concentrações normais de ferro e na ausência de ferro.