Aplicação do eDNA metabarcoding como ferramenta de acesso à biodiversidade da ictiofauna estuarina no litoral de São Paulo

• Processo: 23/07311-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Danillo Pinhal
• Beneficiário: Arthur Padial da Mota
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Assunto(s): Código de barras de DNA taxonômico Conservação DNA ambiental Estuários Ictiofauna Genética da conservação
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: barcoding | Conservação | DNA ambiental | Estuario | ictiofauna | Genética da Conservação

Resumo

Os ecossistemas costeiros vêm sofrendo degradação acelerada de seus ambientes devido à ação antrópica, levando à perda de biodiversidade. Nesse contexto, o levantamento de espécies que habitam essas áreas de transição entre os rios e os mares é um passo fundamental para sua preservação. Contudo, em se tratando de ambientes marinhos costeiros, os métodos tradicionais para estudo da composição da fauna demandam alto custo, além das dificuldades para coleta dos animais e seu caráter invasivo. O DNA ambiental surge como uma alternativa mais eficiente, principalmente associado ao sequenciamento em larga escala (eDNA metabarcoding) para a identificação de amplo espectro da fauna aquática. eDNA são moléculas de DNA encontradas no ambiente originárias de organismos que fornecem informações sobre a comunidade de espécies local. O presente projeto tem por objetivo acessar a biodiversidade costeira, utilizando eDNA metabarcoding, em estuários do litoral norte do estado de São Paulo, as quais estão sujeitas a níveis variáveis de antropização. Amostras de água serão coletadas nos estuários do Rio Juqueriquerê, em Caraguatatuba, e do Rio Escuro, em Ubatuba. Após filtração, o eDNA será isolado e a região 12S do DNA mitocondrial amplificada e submetida ao sequenciamento de alta performance (MiSeq, Illumina). As leituras obtidas serão processadas e comparadas a sequências 12S ou a mitogenomas completos de bancos de dados públicos, para a precisa identificação das espécies. Simultaneamente, serão tomadas medidas in situ (sonda multiparâmetros, transparência, profundidade) e coletadas amostras para determinações laboratoriais (clorofila, sólidos totais e fósforo), a fim de avaliar o impacto da qualidade da água na diversidade de espécies. Ao final, os dados serão disponibilizados em bancos públicos, para auxiliar iniciativas governamentais de conservação ambiental.