Análise metagenômica da microbiota intestinal em aves comerciais: Explorando potencial probiótico, genes de multiresistência e transferência horizontal de genes.

• Processo: 23/10686-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Alessandro de Mello Varani
• Beneficiário: Julia Memrava Cabrera
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/25511-1 - Bioprospecção de bactérias probióticas bacteriocinogênicas: da otimização do cultivo à aplicação em sistemas de produção animal, AP.TEM
• Assunto(s): Genômica Resistência microbiana a medicamentos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Análise genômica | Bacterias probióticas | Evolução genômica | resistencia antimicrobiana | Saúde avícola | Genômica e Bioinformática

Resumo

A microbiota intestinal das aves é uma comunidade complexa, incluindo bactérias, fagos, arqueias, fungos e protozoários. Alterações na composição e diversidade dessa microbiota podem ter impactos significativos na saúde das aves, afetando sua produção, desempenho e bem-estar. Estudos com abordagem genômica, sobretudo com a utilização de ferramentas de sequenciamento metagenômico tem revolucionado esse campo da Ciência, o que proporciona novas oportunidades para investigar a microbiota avícola com maior acurácia. Tais abordagens tem gerado um amplo número de dados e informações altamente complexas, que merecem ser exploradas em maior profundidade. Dessa forma, objetiva-se com esse projeto investigar a microbiota intestinal de aves comerciais (Gallus gallus domesticus) por meio da análise de dados de sequenciamento disponíveis em bases de dados públicas. Especificamente, exploraremos 908 leituras brutas, provenientes do sequenciamento do microbioma intestinal de aves, e 1,511 genomas montados a partir de metagenômas (MAGs), utilizando diversas ferramentas de Bioinformática e aplicando métodos de análise metagenômica. Além disso, buscamos explorar o potencial probiótico dos microrganismos presentes, investigar genes relacionados à multiresistência, compreender o papel desempenhado pela transferência horizontal de genes nas microbiotas avícolas e identificar os loci CRISPR-Cas, para gerar uma compreensão evolutiva das bactérias que compõem este microbioma. Esperamos que os resultados obtidos neste projeto contribuam para um maior entendimento da importância da microbiota intestinal nas aves comerciais. Tal compreensão pode fornecer insights valiosos para a promoção da saúde e do bem-estar animal, além de contribuir para o aperfeiçoamento da produção avícola de maneira sustentável e eficiente.