Desenvolvimento de aptâmeros de DNA contra uropatógenos isolados nas Unidades Básicas de Saúde

• Processo: 23/09791-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Fixação de Jovens Doutores
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2023
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Acordo de Cooperação: CNPq
• Pesquisador responsável: Silvia Figueiredo Costa
• Beneficiário: Marina Farrel Côrtes
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 23/02920-1 - Desenvolvimento de aptâmeros de DNA contra uropatógenos isolados nas Unidades Básicas de Saúde, AP.R
• Assunto(s): Escherichia coli Biologia molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Aptamers | cell-SELEX | coli | E | K | multidrug-resistance | pneumoniae | biologia molecular

Resumo

As infecções causadas por bactérias multirresistentes são um problema de saúde em todo o mundo e uma das principais causas de doenças humanas com altas taxas de mortalidade. Infecções do trato urinário (ITU) estão entre os tipos mais comuns de doenças infecciosas, com aproximadamente 150 milhões de casos por ano em todo o mundo, associadas com alta morbidade e representando elevados custos de cuidados com a saúde. A identificação rápida dessas infecções é fundamental, pois elas podem ser difíceis de tratar, com melhores chances de prognóstico quando a terapia específica é iniciada precocemente. Nesse contexto, o desenvolvimento de metodologias de detecção rápidas e economicamente viáveis, bem como o desenvolvimento de novas alternativas terapêuticas são necessidades urgentes. O desenvolvimento de aptâmeros para reconhecimento específico de agentes infecciosos pode ser uma solução. Além de identificação, a ligação do aptâmero com seu alvo bacteriano pode, ainda, bloquear sua função, agindo como ferramenta terapêutica. No entanto, as tecnologias de aptâmero voltada para bactérias, ainda apresentam muitos reveses, incluindo a dificuldade do processo de seleção. Dentre os patógenos mais frequentemente isolados em casos de ITU destacam-se Escherichia coli. e Klebsiella pneumoniae. O objetivo desse trabalho é selecionar e identificar aptâmeros para os principais uropatógenos isolados de pacientes atendidos nas 34 Unidades Básicas de Saúde (UBS) do município de São Bernardo do Campo. A partir de uma biblioteca, os aptâmeros serão selecionados por meio da técnica cell-SELEX. Uma vez selecionados, os aptâmeros serão identificados utilizando sequenciamento de nova geração e as sequencias mais frequentes serão sintetizadas e triadas para avaliação de especificidade por citometria de fluxo e microscopia de fluorescência; e o potencial bactericida/bacteriostático avaliado por time kill em amostras clínicas de uropatógenos.