Caracterização da microbiota da agrofloresta através da bioinformática: avaliação da saúde do solo via microorganismos

• Processo: 24/03870-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2024
• Data de Término da vigência: 27 de setembro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Ciência do Solo
• Pesquisador responsável: Tsai Siu Mui
• Beneficiário: Rafael Barty Dextro
• Supervisor: Naoaki Ono
• Instituição Sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Nara Institute Of Science And Technology, Japão
• Vinculado à bolsa: 23/08974-6 - Avaliação da agrofloresta conectada a microbiologia do solo da Amazônia, BP.PD
• Assunto(s): Biologia computacional Nutrição vegetal Solos Microbiologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: agrofloresta | bioinformática | Nutrição Vegetal | solo | Microbiologia

Resumo

O estudo da biodiversidade microbiana expandiu-se para incluir análises moleculares que geram grandes dados sobre a diversidade de uma comunidade complexa. O processamento destas análises pode produzir resultados muito interessantes e informativos sobre aspectos ecológicos e biológicos das condições ambientais locais. Porém, para processar esses dados, são necessárias ferramentas de bioinformática com amplo conhecimento de diferentes algoritmos e programação para processar, aparar e avaliar adequadamente os resultados obtidos. O sequenciamento de gDNA de amostras de solo recuperadas de sistemas agroflorestais em Tomé-Açu (Pará-Brasil) é útil para determinar como a microbiota se entrelaça com as condições físico-químicas do solo e a aptidão geral da planta, afetando, em última análise, o valor nutricional de frutas que são essenciais tanto economicamente quanto como principais alimentos das comunidades locais, como o açaí. Este projeto tem como objetivo caracterizar a comunidade microbiana a partir de amostras coletadas em dois sistemas agroflorestais localizados em Tomé-Açu com idades diferentes (18 e 25 anos). As áreas selecionadas são próximas umas das outras e compartilham práticas de manejo semelhantes, incluindo o consórcio de duas espécies vegetais principais (Euterpe oleracea - açaí; Theobroma cacao - cacau). Para determinar a diversidade e os genes funcionais encontrados no pool de microrganismos presentes em três profundidades de solo (0-10 cm/ 10-20 cm/ 20-30cm), os dados sequenciados serão processados no grupo de pesquisa Data Science do Nara Institute of Science and Technology (Japão), que possui fluxo de trabalho e conhecimento adequados para processar esse tipo e quantidade de dados. Os resultados serão depositados em bases de dados públicas após a conclusão do processamento, proporcionando uma visão da diversidade microbiana dos sistemas agroflorestais de Tomé-Açu e como ela pode afetar o valor nutricional dos frutos.