Identificação de peptídeos intracelulares e sua relação com a termogênese: uma abordagem "ômica"

• Processo: 24/13521-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Fixação de Jovens Doutores
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2025
• Área de conhecimento: Interdisciplinar
• Acordo de Cooperação: CNPq
• Pesquisador responsável: Patrícia Reckziegel
• Beneficiário: Paula Paccielli Freire-Barguil
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 24/02202-4 - Identificação de peptídeos intracelulares e sua relação com a termogênese: uma abordagem ômica, AP.R
• Assunto(s): Peptidômica Biologia computacional Metabolismo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Análise Peptidômica | bioinformática | metabolismo | Bioinformática

Resumo

O tecido adiposo marrom (BAT, do inglês brown adipose tissue) é conhecido por sua função termogênica por expressar a proteína de desacoplamento mitocondrial do tipo 1 (Ucp1). Sob certas condições, células do tecido adiposo branco (WAT, do inglês white adipose tissue) podem também expressar essa proteína, adquirindo assim características termogênicas em um processo conhecido como browning. A ativação do BAT e o browning têm sido consideradas estratégias promissoras no combate à obesidade e a transtornos metabólicos correlatos, devido a indução de um aumento do consumo de energia basal e da maior captação de glicose e triglicerídeos pelas células. Peptídeos intracelulares têm se mostrado moduladores de diversas vias metabólicas. Resultados preliminares do Auxílio de Jovem Pesquisador indicam perfis distintos de peptídeos intracelulares entre o BAT e o WAT, e durante o processo termogênico. Compreende-se que ferramentas de bioinformática podem ser úteis na análise desses dados. Logo, o atual projeto tem como objetivo explorar os efeitos biológicos dos peptídeos intracelulares identificados em amostras de BAT e WAT de camundongos sob estímulo termogênico através de ferramentas de bioinformática. Para isso, o perfil de peptídeos intracelulares identificado em tecidos adiposos de camundongos expostos a condições de temperatura de biotério (21°C) ou ao frio (7°C), e/ou tratados com veículo ou pioglitazona (agonista PPAR3) durante 15 dias será analisado por diversas ferramentas de bioinformática, sendo essa uma das expertises da Jovem Doutora indicada. Diferentes abordagens computacionais/estatísticas serão empregadas, tanto para os peptídeos quanto para as proteínas de origem, como: 1) identificação dos processos biológicos afetados; 2) análise de módulos de co-expressão para visualização dos conjuntos de peptídeos que se manifestam da mesma forma nas diferentes condições; e 3) algoritmos de aprendizado de máquina serão utilizados para a predição dos peptídeos intracelulares mais representativos dentro de cada grupo experimental. Por fim, iremos realizar cultura primária de células adiposas marrons e brancas, analisar o perfil de peptídeos e compará-los com os dados obtidos pela peptidômica obtida nos tecidos nas análises anteriores. Assim, pretende-se caracterizar o papel de peptídeos intracelulares em BAT versus WAT, e predizer a função biológica desses peptídeos nas células, se relacionada a termogênese. Essas análises também podem predizer novos compostos peptídicos com potencial para o tratamento da obesidade e doenças associadas. (AU)