Análise do estado metabólico do microambiente tumoral utilizando dados transcriptômicos espaciais

• Processo: 24/07593-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2024
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Tathiane Maistro Malta Pereira
• Beneficiário: Felipe Pimenta Carcanholo
• Supervisor: Jasmine Plummer
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: St. Jude Children's Research Hospital, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 22/16458-5 - Avaliação do estado metabólico do microambiente do glioma usando dados transcriptômicos de célula única, BP.IC
• Assunto(s): Metabolismo Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: metabolism | single cell | Spatial transcriptomic | Bioinformática

Resumo

Os gliomas são tumores cerebrais heterogêneos com baixa resposta terapêutica e são classificados com base nas características moleculares e no grau histológico de malignidade. Uma marca registrada do câncer é a reprogramação do metabolismo energético para atender às altas demandas energéticas do rápido crescimento do tumor, permitindo a proliferação descontrolada de células. O microambiente tumoral é altamente heterogêneo, composto por vários tipos de células distintas. Esta complexidade representa um desafio para estudos que dependem exclusivamente de perfis de massa, pois podem perder informações críticas sobre a variabilidade entre células. É necessário analisar o transcriptoma no nível unicelular para entender melhor as funções e o comportamento celular. Para avançar ainda mais, é importante considerar não apenas cada célula individualmente, mas também a sua localização espacial. A tecnologia ômica espacial combina sequenciamento de última geração e multiplexação de alto nível com técnicas avançadas de imagem, proporcionando uma compreensão mais profunda e clara da distribuição espacial da expressão gênica, transições de estado celular e interações célula-célula. Este projeto tem como objetivo investigar a reprogramação metabólica de células no microambiente intratumoral através da análise de dados transcriptômicos espaciais. Utilizaremos dados moleculares espaciais e aplicaremos o algoritmo que estabelecemos durante este projeto de iniciação científica para quantificar a atividade de vias metabólicas distintas. Essa pesquisa tem o potencial de revelar interações celulares intrincadas e padrões organizacionais em múltiplas dimensões, acelerando assim as descobertas e melhorando a nossa compreensão das interações entre diferentes subtipos celulares.