Desenvolvimento de um sistema para a identificação e caracterização de peptídeos associados à adsorção de bacteriófagos de Xanthomonas citri

• Processo: 24/12387-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2024
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2028
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Pesquisador responsável: Henrique Ferreira
• Beneficiário: Mario Nicolas Caccalano
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/10577-0 - Centro de Pesquisa em Biologia de Bactérias e Bacteriófagos (CEPID B3), AP.CEPID
• Assunto(s): Bacteriófagos Fitopatologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bacteriófagos | compound delivery | controle do cancro cítrico | fitopatologia

Resumo

Bacteriófagos são vírus que infectam bactérias de maneira específica. Com o aumento da resistência aos antimicrobianos e uma menor disponibilidade de drogas capazes de controlar infecções multidroga-resistentes, os bacteriófagos estão sendo re/considerados como alternativas para o combate de infecções bacterianas. Durante a infecção do bacteriófago na célula hospedeira/alvo, proteínas localizadas na cauda do vírus (Receptor Binding Proteins, RBP) reconhecem receptores específicos na superfície bacteriana. A ligação do vírus na bactéria é denominada adsorção, na qual o reconhecimento entre as proteínas de cauda (RBPs) e os receptores localizados na superfície bacteriana é bastante específico. Com isso, RBPs apresentam um alto potencial para serem utilizados para a identificação de linhagens de bactérias (fagotipagem), bem como um possível agente de delivery específico de anti-bacterianos. O presente projeto tem como objetivo identificar RBPs de um fago lítico de X. citri, seu receptor na bactéria e explorar o uso dessas RBPs como possível agente de delivery de antimicrobianos. Pretendemos caracterizar RBPs de um fago de Xanthomonas citri (X. citri) e utilizá-los como possíveis agentes carreadores de compostos anti-X. citri e ao mesmo tempo, identificar os receptores bacterianos utilizados pelo fago, o que é crucial para otimizar a fogoterapia. Para tal, construiremos uma biblioteca genômica de um bacteriófago lítico de X. citri utilizando um vetor que permite a expressão de proteínas/peptídeos associados à membrana externa de E. coli (técnica de protein display). Na sequência, faremos a interação entre esta biblioteca de E. coli expressando variadas proteínas fágicas, e possivelmente RBPs, com linhagens de X. citri sensíveis a infecção. Complexos proteicos resgatados utilizando-se técnicas de cross-linking serão identificados por espectrometria de massas. Peptídeos fágicos identificados poderão ser explorados como agentes carreadores de antibacterianos.