Ferramentas computacionais para integração e análise de bancos de dados de sequenciamento completo do genoma bovino

• Processo: 24/20117-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Ricardo Vieira Ventura
• Beneficiário: Lucas Tassoni Andrietta
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/03101-9 - COWADAPT: detecção de variantes genéticas associadas com a adaptação de bovinos a ambientes desafiadores utilizando um multi-assembly graph como referência, AP.TEM
• Assunto(s): Genoma de referência Análise de dados
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: cattle adaptation | DNA structural variants | indicine cattle | Melhoramento Genético de Bovinos de Corte | multi-assembly graph | reference genome | Analise de dados

Resumo

O desenvolvimento do projeto temático a que se vincula esta bolsa necessitará de poderosos recursos computacionais, alémde uma série de softwares e algoritmos específicos (alguns ainda em desenvolvimento). O profissional de TI a sercontratado atuará, então, em duas frentes complementares e de suma importância para o desenvolvimento do projetoproposto. 1) O mesmo ficará responsável pelo gerenciamento dos computadores, incluindo instalação e otimização deprogramas e softwares, manutenção de infraestrutura de rede e intranet e 2) atuará juntamente com os pesquisadores doprojeto na implementação, gerenciamento e análise de grandes bancos de dados, incluindo o desenvolvimento de pipelinesalgoritmos específicos ao projeto, exigindo experiência prévia em genômica e melhoramento animal.