Papel dos ortólogos de RppH e NudC na homeostase de RNA em Caulobacter

• Processo: 24/23478-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Marilis Do Valle Marques
• Beneficiário: Lucas Spitzer
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/10577-0 - Centro de Pesquisa em Biologia de Bactérias e Bacteriófagos (CEPID B3), AP.CEPID
• Assunto(s): Caulobacter Processamento de RNA Regulação da expressão gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: capping dos mRNAs | Caulobacter | degradossomo de RNA | Nudix | processamento de RNA | Regulação gênica

Resumo

A regulação do ciclo celular e da resposta a estresses requer mecanismos transcricionais e pós-transcricionais, que mediam a concentração dos transcritos de mRNA na célula e sua tradução. Neste sentido, processos de degradação de RNAs têm papel importante na finalização das respostas, na reciclagem de nucleotídeos, na mudança de perfil de expressão genica e adaptação. O degradossomo de RNA é um complexo multienzimático que participa na degradação do RNA em bactérias, onde a endonuclease RNase E se liga a outras enzimas para realizar a degradação de RNAs. Os mRNAs bacterianos possuem modificações na sua extremidade 5', podendo ser um nucleotídeo trifosfatado ou um capping pela adição de outras moléculas, por exemplo NAD. Enzimas específicas retiram estes caps, deixando a extremidade 5'-monofosfato, que tem uma maior suscetibilidade à clivagem pela RNase E. A enzima responsável por transformar mRNAs 5'-trifosfato em 5'-monofosfato é a pirofosfohidrolase RppH, e a que remove o NAD dos transcritos é a fosfohidrolase NudC. Ambas são membros da família NUDIX de hidrolases, que possuem o domínio conservado Nudix. Neste projeto propomos estudar duas enzimas desta família em Caulobacter crescentus que são os prováveis ortólogos de RppH e NudC, analisando seu papel na degradação de RNA e na regulação genica global.