EccBR: Vigilância genômica do complexo Enterobacter cloacae em Saúde Única para controle, diagnóstico e manejo da resistência aos antimicrobianos no Brasil

• Processo: 24/07885-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Nilton Erbet Lincopan Huenuman
• Beneficiário: Karine Sousa Dantas
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Carbapenemases Farmacorresistência bacteriana Vigilância genômica Genes de virulência
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: carbapenemase | one health | Resistência Bacteriana | resistoma | Vigilância genômica | viruloma | Resistencia bacteriana

Resumo

A investigação de patógenos emergentes, sua correta identificação taxonômica e a avaliação do perfil de resistência aos antibióticos são essenciais para o controle e manejo de doenças infecciosas que podem ter uma evolução endêmica ou pandêmica, com consequências para a saúde humana, animal e ambiental, devendo ser abordados dentro do conceito de Saúde Única (One health). A alta prevalência e endemicidade de espécies do complexo Enterobacter cloacae (ECC) nas infecções relacionadas à assistência à saúde tem sido suportada pela combinação da virulência e da aquisição de genes de resistência aos antimicrobianos. Embora Enterobacter spp. resistentes às cefalosporinas de amplo espectro e aos carbapenêmicos tenha sido classificado como patógenos de prioridade crítica pala OMS, os sistemas de diagnóstico laboratoriais ainda falham em diferenciar as espécies do ECC. O presente projeto tem como objetivos realizar a vigilância genômica do complexo E. cloacae em Saúde Única no Brasil, para identificar a real prevalência das espécies do ECC em infecções humanas e animais; gerar e disponibilizar dados para auxiliar no diagnóstico, controle e manejo da resistência aos antimicrobianos. Os isolados de Enterobacter spp. serão encaminhados por laboratórios clínicos e pesquisadores para identificação das espécies (MALDI-TOF) e do perfil de sensibilidade antibacteriana (disco-difusão; concentração inibitória mínima, CIM). Isolados com diferentes perfis de resistência serão selecionados para sequenciamento Illumina (NextSeq), e os genomas serão analisados utilizando ferramentas de bioinformática para montagem; anotação; predição do resistoma, mobiloma, viruloma, CRISPR, MLST e pMLST; e análise filogenômica através da construção de árvores filogenéticas baseadas em SNPs (single nucleotide polimorphism). Paralelamente, será criado o banco de dados EccBR no domínio do OneBR (http://www.onehealthbr.com/), para disponibilizar dados microbiológicos e genômicos de importância clínica e epidemiológica.