Montagens de Genoma em Nível Cromossômico para Espécies Ameaçadas de Dyckia: Um Caminho para Compreender a Adaptação e a Conservação

• Processo: 25/03280-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 20 de junho de 2025
• Data de Término da vigência: 19 de dezembro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Maria Imaculada Zucchi
• Beneficiário: João Victor da Silva Rabelo Araujo
• Supervisor: Ovidiu Paun
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Vienna, Áustria
• Vinculado à bolsa: 23/00765-9 - Filogenômica, genômica populacional e identificação via CRISPR SHERLOCK de complexo de Dyckias do quadrilátero ferrífero de Minas Gerais, BP.DD
• Assunto(s): Genômica comparativa Genômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bromeliads | campo rupestre | Comparative Genomics | Genome assembly | Genome evolution | Genomics | Genômica ecológica

Resumo

Estamos vivenciando uma era sem precedentes de extinções em massa, impulsionada pela expansão humana em áreas não florestadas, resultando na perda silenciosa de espécies adaptadas a ambientes extremos. A investigação da diversidade genética e da adaptação genômica em táxons pouco descritos pode ajudar a esclarecer padrões de diversificação e apoiar esforços de conservação.Dyckia Schult. & Schult.f., um gênero de bromélias xeromórficas, apresenta sua maior diversidade na porção sul da Cadeia do Espinhaço, especificamente na região do Quadrilátero Ferrífero (QF), que sofre intensa pressão da mineração. Dyckia consimilis e D. rariflora são duas espécies ameaçadas, com populações pequenas e restritas a solos pobres em nutrientes e ricos em ferro em afloramentos rochosos de alta altitude, conhecidos como "canga". Devido à alta demanda por minério de ferro, essas espécies estão em risco constante de extinção, pois a maioria de suas populações não está protegida e encontram-se próximas a áreas de mineração ativas.Estudos filogenéticos sugerem que D. consimilis e D. rariflora, apesar de serem estreitamente relacionadas, representam linhagens evolutivas distintas, com adaptações únicas a solos oligotróficos ricos em ferro, incluindo resistência diferencial ao fogo e a condições ambientais extremas. O projeto BEPE tem como objetivo estabelecer as bases para estudos de genômica da conservação dessas espécies ameaçadas do QF, por meio da geração de montagens e anotações genômicas para Dyckia, em colaboração com o grupo de Genômica Ecológica de Plantas da Universidade de Viena.Utilizando tecnologias avançadas de sequenciamento, como PacBio e Hi-C, serão produzidas montagens genômicas de alta qualidade para compreender a radiação evolutiva recente de Dyckia na Cadeia do Espinhaço. O projeto oferecerá treinamento em análises genômicas, com foco na montagem de genomas e anotação gênica, além de iniciar uma colaboração de longo prazo abrangendo genômica comparativa, delimitação de espécies e genômica da conservação.