Abordagem Computacional para Identificação de Reatividade Cruzada de Receptores de Células T através de estruturas 3D de Epítopos

• Processo: 25/00373-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
• Pesquisador responsável: Helder Veras Ribeiro Filho
• Beneficiário: Carlos Daniel Marques Santos Simões
• Instituição Sede: Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM). Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (Brasil). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Linfócitos T Epitopos Teoria dos grafos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Células T | Epitopos | Reatividade cruzada | Teoria de Grafos | Estrutura e Interação de proteínas

Resumo

Avanços recentes no entendimento das respostas imunológicas mediadas por células T têm possibilitado o desenvolvimento de terapias inovadoras contra tumores, assim como vacinas que exploram a resposta dessas células contra antígenos virais. A interação entre receptores de células T (TCR) e epítopos apresentados na forma de peptídeos ligados a uma molécula de MHC (pMHC) é o evento chave para o funcionamento de imunoterapias baseadas em células T. Entretanto, apesar dos avanços, essas terapias enfrentam um desafio significativo: a reatividade cruzada de TCRs. Essa reatividade refere-se à capacidade potencial dessas células, por meio de seus TCRs, de reconhecer epítopos indesejados, incluindo epítopos próprios, o que pode resultar em respostas autoimunes e efeitos adversos. Nesse contexto, métodos computacionais capazes de identificar, de forma rápida e eficaz, potenciais reatividades cruzadas entre epítopos tornam-se altamente relevantes. Portanto, neste projeto de pesquisa, propomos o desenvolvimento de uma ferramenta computacional baseada em teoria de grafos, com a integração de informações estruturais e físico-químicas, para identificar regiões na superfície de estruturas de pMHCs que possam levar à reatividade cruzada. Essa ferramenta, que será disponibilizada como um servidor web para a comunidade científica, também contribuirá para o aprofundamento do entendimento das bases moleculares que guiam a reatividade cruzada.