Caracterização do viroma da batateira (Solanum tuberosum L.) no Brasil e aperfeiçoamento do diagnóstico dos agentes infecciosos acelulares

• Processo: 24/22173-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Pesquisador responsável: Juliana de Freitas Astúa
• Beneficiário: Gianluca de Lima Michea Gonzalez
• Instituição Sede: Instituto Biológico (IB). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/11965-3 - Centro de manejo sustentável de pragas doenças e plantas daninhas, AP.CCD
• Assunto(s): Reação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa quantitativa (qRT-PCR) Sequenciamento de alta performance
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: ensaio multiplex | Hts | Identificação e detecção de vírus | RT-qPCR | Sequenciamento de alta performance | Fitovirologia

Resumo

A batateira (Solanum tuberosum L.) é uma planta originária da cordilheira dos Andes, na América do Sul. Seu cultivo se estende globalmente devido ao seu ciclo curto, alta produtividade, valor nutricional e versatilidade culinária do seu tubérculo. A batata é considerada a terceira maior fonte de alimento para a humanidade e no Brasil contribui para a segurança alimentar e a economia agrícola. A bataticultura brasileira padece com a insuficiente produção de tubérculos-sementes e com a incidência de vários agentes infecciosos acelulares (AIAs - que inclui vírus e viroides) que potencialmente podem afetar até 50% da produção. Tanto os AIAs já presentes no país, como aqueles que poderiam ser introduzidos de regiões próximas e países exportadores dos tubérculos-sementes, conseguiriam se espalhar facilmente via tubérculos e/ou por meio de diferentes vetores. O presente projeto visa caracterizar o viroma da batateira no Brasil, e em consequência aprimorar ou desenvolver testes para o diagnóstico dos agentes de maior relevância econômica e epidemiológica. Serão coletadas amostras de folhas de batateira em várias regiões agrícolas e os extratos de ácidos nucleicos serão sequenciados mediante tecnologias de alta performance (HTS, high-throughput sequencing). Análises bioinformáticas serão realizadas para identificar os AIAs presentes e sua filogeografia. Com os genomas identificados serão desenhados iniciadores específicos para validar os resultados de HTS e otimizar os métodos de detecção. Testes quantitativos em uma etapa para a detecção múltipla dos patógenos mediante uma reação acoplada de transcrição reversa e PCR (one step RT-qPCR) serão desenvolvidos. A identificação específica dos patógenos ocorrerá através das análises das curvas de temperatura de dissociação dos amplicons gerados. A execução do projeto contribuirá com a expansão do conhecimento sanitário da cultura da batateira no Brasil, a indicação das possíveis rotas de introdução de novos AIAs no país, e a geração de ferramentas acuradas para a detecção dos agentes causais prevalentes ou de interesse quarentenário.