Avaliação da diversidade genética global do gene AIRE e estudo de associação com o vitiligo em uma amostra da população brasileira

• Processo: 24/13641-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Eduardo Antônio Donadi
• Beneficiário: Pedro Mendes Laprega
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Diversidade genética Imunogenética Vitiligo Genética populacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Diversidade Genética | Imunogenética | Regulador Autoimune (AIRE) | Vitiligo | Genética de Populações

Resumo

A diversidade genética humana e seu impacto sobre os produtos gênicos é um dos temas mais centrais da biologia, considerando suas implicações sobre a história evolutiva e a saúde. Dessa forma, a caracterização minuciosa dessa variabilidade se mostra de grande interesse para auxiliar no avanço científico, principalmente se tratando de genes associados a processos fisiológicos de grande importância. Dentre eles, o gene AIRE ocupa papel central no processo de autotolerância imunológica, o qual, por sua vez, é essencial para a prevenção de condições autoimunes, como o vitiligo. No entanto, pouco está disponível sobre aspectos gerais da diversidade desse gene, principalmente se considerarmos a análise de dados de sequenciamento massivo em paralelo e de um contexto brasileiro. Dessa forma, pretende-se caracterizar minuciosamente as variantes genéticas globais em relação a alelos de sítios de variação e haplótipos de regiões regulatórias e codificantes, buscando identificar assinaturas de seleção natural moldando a diversidade genética de tais regiões. Isso será feito utilizando (a) dados de genotipagem em larga escala de uma amostra de 513 brasileiros, dos quais 68 apresentam vitiligo, obtidos por meio do MEGA array (Illumina) e imputação de genomas completos, e (b) 4131 indivíduos provenientes de dois bancos de diversidade genética em escala mundial, The 1000 Genomes Project e o Human Genome Diversity Project. Tendo isso em vista, será possível realizar estudo de associação caso-controle do gene AIRE com esse distúrbio de pigmentação autoimune para essa população utilizando método de regressão logística, ajustado para os efeitos de ancestralidade genômica global e local (origem ancestral de cada haplótipo do gene AIRE) de cada indivíduo da amostra miscigenada. (AU)