Explorando a resistência a imunoterapia mediada por lncRNA em melanoma através de análise espacial

• Processo: 25/05877-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 11 de novembro de 2025
• Data de Término da vigência: 10 de novembro de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Miriam Galvonas Jasiulionis
• Beneficiário: Beatriz Cristina Biz Tonin
• Supervisor: Frank John Slack
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Harvard University, Boston, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 23/17737-8 - Identificação de lncRNAs com papel na progressão do Melanoma e na resistência a imunoterapia, BP.DD
• Assunto(s): Análise espacial Imunoterapia Melanoma Microambiente tumoral Biologia tumoral
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Análise Espacial | imunoterapia | melanoma | microambiente tumoral | RNAs longos não codificantes | Biologia do câncer

Resumo

A transcriptômica espacial emergiu como uma ferramenta poderosa para compreender a dinâmica da expressão gênica dentro da arquitetura tecidual. Essa tecnologia é particularmente valiosa para mapear as interações entre o sistema imunológico e o tumor, bem como a expressão gênica. No entanto, sua aplicação ainda é limitada, especialmente no estudo de RNAs longos não codificantes (lncRNAs), que são reguladores-chave da expressão gênica e desempenham papéis críticos na progressão do melanoma.Este projeto propõe utilizar a plataforma Visium (10x Genomics) para identificar mRNAs e lncRNAs diferencialmente expressos em células tumorais, células imunes e componentes do estroma a partir de amostras de melanoma de pacientes que respondem (respondedores) ou não (refratários) aos inibidores de checkpoints imunológicos (ICIs). Análises bioinformáticas serão conduzidas para selecionar os lncRNAs mais relevantes associados aos mecanismos de resistência. Os candidatos mais promissores serão posteriormente investigados por meio da identificação de ortólogos em modelos murinos, possibilitando a validação funcional in vivo em um ambiente imunocompetente.Além das contribuições científicas, este estudo será fundamental para a introdução e consolidação das metodologias de transcriptômica espacial no Brasil (Equipamento Multiusuários, EPM/UNIFESP), promovendo expertise técnica e facilitando o acesso a tecnologias avançadas para grupos de pesquisa locais. Ao integrar a análise espacial com o perfil de resistência, este estudo fornecerá novos insights sobre o papel dos lncRNAs na resposta à imunoterapia. Os achados contribuirão para a consolidação das metodologias de transcriptômica espacial e para a identificação de potenciais biomarcadores e alvos terapêuticos para o tratamento do melanoma. (AU)