Investigação sobre o papel de pequenos peptídeos em glioblastoma

• Processo: 25/04531-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica
• Pesquisador responsável: João Carlos Setubal
• Beneficiário: Luiza Dias Marques
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Glioblastoma Proteômica Transcriptoma Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: glioblastoma | proteômica | Transcriptoma | Bioinformática

Resumo

O glioblastoma multiforme (GBM) é um tumor cerebral agressivo e de difícil tratamento, com resistência atribuída a processos moleculares complexos, como reparo do DNA e desregulação transcricional e traducional. Recentemente, os RNAs longos não codificantes (lncRNAs) emergiram como reguladores-chave no GBM, destacando-se pelo potencial de codificar pequenos peptídeos (SEPs) por meio de pequenas ORFs (sORFs). Esses peptídeos têm funções biológicas relevantes, incluindo regulação de vias tumorais, tornando-se potenciais alvos terapêuticos. Este estudo visa integrar abordagens transcriptômicas e proteômicas para caracterizar lncRNAs codificantes de SEPs e suas interações no contexto do cenário translacional do GBM para identificação de possíveis alvos terapêuticos. Utilizando dados de polysome profiling de linhagens modelo, serão identificados lncRNAs diferencialmente expressos com potencial traducional. A análise funcional revelará as vias biológicas associadas a esses lncRNAs e seus peptídeos. Redes de coexpressão serão construídas para inferir mecanismos regulatórios. A validação proteômica será realizada por meio de dados de espectroscopia de massas, empregando o algoritmo moPepGen para detectar peptídeos não canônicos. Por fim, a integração com dados clínico-patológicos do Atlas do Genoma do Câncer (TCGA) permitirá avaliar a relevância prognóstica dessas moléculas. Ao elucidar a tradução e o papel funcional de SEPs derivados de lncRNAs, este estudo busca identificar novos alvos biomarcadores e potenciais estratégias terapêuticas para o GBM.