Investigação dos mecanismos genéticos associados a características promotores de crescimento em rizobactérias de citros

• Processo: 25/12255-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia
• Pesquisador responsável: Helvecio Della Coletta Filho
• Beneficiário: Helena Santiago Lima
• Supervisor: Victor J Carrion Bravo
• Instituição Sede: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Universidad de Málaga (UMA), Espanha
• Vinculado à bolsa: 23/03131-0 - Identificação e seleção de comunidades sintéticas estabelecidas de rizobactérias de plantas cítricas, BP.PD
• Assunto(s): Genômica comparativa Microbiologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Comparative Genomics | Plant growth-promoting bacteria | rhizosphere microbiome | microbiologia

Resumo

O microbioma da rizosfera desempenha um papel central na saúde das plantas, influenciando a aquisição de nutrientes, a resiliência ao estresse e a arquitetura do sistema radicular. Apesar do reconhecido potencial biotecnológico das rizobactérias, a maior parte dos microrganismos do solo permanece não cultivável, o que limita o acesso a características benéficas. Este projeto tem como objetivo elucidar a base genômica de características associadas à promoção de crescimento em rizobactérias cultiváveis da rizosfera de citros, por meio de uma abordagem centrada no genoma. Anteriormente, estabelecemos uma coleção de culturas composta por 15.660 isolados obtidos de solos rizosféricos de citros coletados em diferentes regiões e estações do Estado de São Paulo, Brasil. A partir dessa coleção, foram selecionados 135 isolados que apresentaram efeitos in vivo distintos em mudas de citros, incluindo: (i) aumento nutricional, (ii) incremento de biomassa e (iii) alterações morfológicas no sistema radicular, para caracterização genômica. Com o intuito de investigar os mecanismos moleculares subjacentes a esses efeitos benéficos, os isolados selecionados serão submetidos ao sequenciamento completo do genoma e a análises funcionais. O DNA genômico será extraído e sequenciado utilizando a tecnologia Oxford Nanopore, seguido por montagem de genomas de novo, anotação e análises genômicas comparativas. Genes associados a características funcionais (TAGs) e clusters de genes biossintéticos (BGCs) serão identificados com o uso da ferramenta bacLIFE, desenvolvida pela instituição anfitriã. Os resultados esperados incluem a identificação de assinaturas genéticas ligadas a características benéficas às plantas e a priorização de cepas elite de rizobactérias para formulação de consórcios microbianos sintéticos voltados à promoção da resiliência dos citros em condições de campo no Brasil. Esses marcadores genômicos também servirão como ferramentas valiosas para investigações futuras da coleção de isolados, permitindo a identificação e priorização de cepas com características promotoras do crescimento vegetal para aplicações subsequentes.