Geometria de Proteínas e o Espaço Conforme

• Processo: 25/19235-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2030
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Matemática - Matemática Aplicada
• Pesquisador responsável: Carlile Campos Lavor
• Beneficiário: Guilherme Philippi
• Instituição Sede: Instituto de Matemática, Estatística e Computação Científica (IMECC). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 23/08706-1 - Métodos computacionais de otimização, AP.TEM
• Assunto(s): Conformação molecular Geometria de distâncias
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Algebra Gemétrica Conforme | Conformação Molecular | Geometria de distâncias | Geometria Molecular

Resumo

A interseção de esferas desempenha papel central no modelo combinatório do Molecular Distance Geometry Problem (MDGP), uma formulação clássica para o problema do cálculo de estruturas moleculares a partir de distâncias exatas. Entretanto, quando as distâncias fornecidas por experimentos de Ressonância Magnética Nuclear (RMN) são representadas por intervalos, surge a necessidade de considerar interseções de cascas esféricas, tradicionalmente tratadas por técnicas de amostragem e pelo uso de aritmética intervalar. Neste projeto, propomos investigar o uso da Álgebra Geométrica Conforme como alternativa na descrição de esferas e cascas esféricas. Essa formulação permite calcular diretamente as interseções de cascas esféricas sem recorrer à amostragem de pontos, integrando a abordagem combinatória do MDGP, baseada em árvores de busca, a uma representação capaz de refletir de maneira mais natural as características contínuas dos dados experimentais. O objetivo é desenvolver uma estrutura teórica e computacional para lidar com distâncias intervalares de modo mais preciso e eficiente. (AU)