Estudo da interação entre proteínas com domínios de ligação a RNA e ncRNAs intrônicos envolvidos em processos de regulação da expressão gênica

• Processo: 09/15264-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2009
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Sergio Verjovski Almeida
• Beneficiário: Kleber Simônio Parreira
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 07/59168-7 - Caracterização funcional de RNAs intrônicos não-codificadores expressos no genoma humano, AP.TEM
• Assunto(s): Expressão gênica RNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Caracterização Funcional | expressão gênica | ncRNAs | RNAi | RNAs intrônicos | super-expressão | Expressão gênica em eucariotos

Resumo

Evidências de que o genoma humano é quase completamente transcrito em RNAs não-codificadores (ncRNAs) têm se acumulado (ENCODE-Project-Consortium, Birney et al. 2007) (Nakaya, Amaral et al. 2007). Postula-se que essas moléculas são fundamentais para a evolução de atributos eucarióticos complexos, como os observados em humanos. Entretanto pouco se conhece a respeito dos programas genéticos e moleculares que orquestram esses atributos durante a homeostase, ou como eles são perturbados durante o desenvolvimento de doenças. RNAs não-codificadores controlam a expressão gênica atuando em eventos transcricionais, pós-transcricionais e traducionais. Funções regulatórias podem estar sendo realizadas pelo próprio ncRNA, porém é mais provável que sejam desempenhadas através de interações com proteínas ligadoras de RNA (RBPs). Nesses complexos o ncRNA pode funcionar como um adaptador molecular que adiciona especificidade às funções regulatórias desempenhadas. Já foi mostrado, separadamente, que a expressão tanto de ncRNAs quanto de RBPs é perturbada em diversas doenças humanas como o câncer. Assim o estudo proposto aqui, almeja obter de forma sistemática mais evidências sobre a relação entre ncRNAs intrônicos e RBPs em processos de regulação da expressão gênica, e sua modificação em doenças como o câncer. Um estudo bastante interdisciplinar utilizando imunoprecipitação de RNAs (RIP), imunoprecipitação de cromatina (ChIP), análise de expressão gênica, bioinformática e ensaios funcionais de biologia celular foi desenhado e encontra-se brevemente descrito abaixo. Com isso visamos obter maiores informações tanto sobre os papéis celulares dos ncRNAs intrônicos, quanto sobre os mecanismos moleculares pelos quais eles os realizam. (AU)