Análise da expressão gênica diferencial em tumores de pulmão e próstata utilizando micro-arrays de DNA

• Processo: 00/04906-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2000
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2005
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Sergio Verjovski Almeida
• Beneficiário: Eduardo Moraes Rego Reis
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 02/13283-6 - Identificação de marcadores moleculares para diagnóstico e prognóstico em câncer utilizando microarrays de DNA, AP.TEM
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cancer | Dna-Microarray | Expresao Genica | Marcadores Moleculares | Prostata | Pulmao

Resumo

Pretende-se nesse projeto identificar genes expressos diferencialmente em tumores de pulmão e próstata. O perfil da expressão gênica em cada amostra testada (tecido normal ou tumoral) será obtido pela hibridação de uma população de cDNAs marcados representante do seu transcriptoma, obtida apos a transcrição reversa do mRNA extraído da amostra, com um "microarray" de DNA contendo milhares de genes humanos. A intensidade da marcação observada para cada gene no "microarray" será proporcional a expressão desse gene na amostra estudada. A hibridação em paralelo de uma população de cDNA referência marcada com um fluoróforo distinto permitirá a normalização do sinal de marcação para cada gene e a comparação dos níveis de expressão entre diferentes amostras de tecido. Os genes aplicados no "microarray" serão selecionados a partir dos 300.1300 clones físicos gerados no âmbito do projeto FAPESP/LICR de seqüenciamento do genoma humano do câncer. Estima-se que uma fração significativa dessas seqüências (10-25%) correspondam a genes ainda desconhecidos. Assim, a estratégia utilizada deverá permitir a identificação de novos marcadores moleculares que poderão ser úteis no diagnóstico e/ou prognóstico de doenças malignas de grande incidência e mortalidade no estado de São Paulo e no Brasil. (AU)