Identificação e caracterização de riboswitches em mRNAs de genes cujos produtos estão envolvidos na biossíntese de tiamina em Arabidopsis thaliana

• Processo: 04/13549-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2005
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2006
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Márcio de Castro Silva Filho
• Beneficiário: Diana Bahia
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Aptamero | Arabdopsis | Riboswitch | Tiamina Pirofosfato

Resumo

Riboswitches são domínios altamente estruturados dentro de mRNAs que atuam como acurados sensores de metabólitos. A união do metabólito (ligante) ao aptâmero localizado dentro da região de riboswitch promove rearranjos alostéricos da estrutura de mRNA, resultando na modulação da expressão gênica. Em procariotas, já foram identificadas sete classes distintas de aptâmeros naturais (riboswitches) que reconhecem oito metabólitos fundamentais. A biossíntese de tiamina em plantas é ainda um processo desconhecido. Em Arabidopsis foi encontrado um elemento putativo na região 3'UTR que está em conformidade com o domínio de união ao TPP ou TPP riboswitch (thiC de E. coli). Devido à sua conservação evolucionária, argumenta-se que a origem dos riboswitches deve ser anterior ao advento das proteínas. O presente trabalho visa identificar novos candidatos que possuam aptâmeros putativos nas vias de biossíntese da tiamina, inicialmente em Arabidopsis e, depois, em outras plantas. Pretende-se fazer construções com o domínio TPP riboswitch (gene THIC) de Arabidopsis com e sem a presença do aptâmero e verificar se há modulação da tradução. Serão realizados experimentos de expressão e localização subcelular com a construção do gene multado. Finalmente, deseja-se realizar um estudo evolutivo sobre genes que contenham aptâmeros em plantas, não apenas relacionados À biossíntese da tiamina. (AU)