Algoritmos e programas para auxílio na determinação de estruturas de DNA genômico

• Processo: 98/04352-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 1998
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 1999
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Teoria da Computação
• Pesquisador responsável: João Carlos Setubal
• Beneficiário: Cesar Augusto da Silva Scolar
• Instituição Sede: Instituto de Computação (IC). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Genoma bacteriano Estrutura do DNA Análise de sequência de DNA

Resumo

Este projeto tem por objetivo permitir ao candidato estudar algoritmos e testar programas que auxiliam na determinação de estruturas de DNA genômico, em particular genes. Os estudos do candidato deverão numa fase inicial focalizar o programa "Glimmer", de domínio público e utilizado em projetos de sequenciamento de genomas de bactérias pelo The Institute for Genomic Research (EUA). Esperam-se os seguintes resultados para o projeto: um texto explicativo e sintetizador dos diversos aspectos do tema estudados; e um relato das experiências com o Glimmer, procurando caracterizar seus falsos positivos e falsos negativos. Espera-se também que o candidato colabore de diversas formas com o projeto GENOMA. (AU)