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Identificação de RNAs não codificantes em transtornos neuropsiquiátricos

Processo: 07/01549-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de agosto de 2007
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2009
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação
Pesquisador responsável:Carlos Alberto de Bragança Pereira
Beneficiário:Ariane Machado Lima
Instituição-sede: Instituto de Matemática e Estatística (IME). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Biologia computacional

Resumo

RNAs não codificantes (ncRNAs) são RNAs funcionais que, ao invés de serem traduzidos para proteínas, desempenham eles mesmos diversas atividades importantes. Muitos deles exercem um papel regulatório do mecanismo de expressão gênica, controlando a atividade de diversos genes, codificantes ou não. Mutações ou a má regulação desses ncRNAs estão relacionadas com diversas doenças como câncer, doenças neurológicas e distúrbios psiquiátricos. Um distúrbio psiquiátrico de relevância mundial é conhecido como Transtorno Obsessivo-Compulsivo (TOC). O TOC é um distúrbio psiquiátrico que causa acentuado sofrimento e/ou prejuízo funcional e que afeta aproximadamente 1 a 3% da população mundial. A descoberta das bases moleculares e causas genéticas desta doença pode auxiliar no desenvolvimento de novas terapias. Ainda não foi identificado nenhum ncRNA associado ao TOC. No entanto, recentes e constantes descobertas têm evidenciado a importância da atuação de ncRNAs, especialmente no cérebro, assim como têm revelado o envolvimento desses ncRNAs em muitas doenças neuropsiquiátricas. Dentre essas doenças estão esquizofrenia, síndrome de Tourette, Prader-Willi e X frágil, sendo que as três primeiras apresentam comorbidade com TOC. Considerando essas evidências, este trabalho tem como objetivo geral verificar a existência de ncRNAs associados ao TOC, levando em consideração a presença ou não de outras doenças relacionadas ao espectro obsessivo compulsivo como a síndrome de Tourette, tiques e febre reumática.Este projeto está inserido nas linhas de pesquisa do “Projeto Transtornos do Espectro Obsessivo-Compulsivo” (PROTOC), do Departamento e Instituto de Psiquiatria do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (IpQ-HC-FMUSP). Especificamente, o projeto faz parte do Projeto Temático no. 2005/55628-8 - “Caracterização Fenotípica, Genética, Imunológica e Neurobiológica do Transtorno Obsessivo-Compulsivo e suas Implicações para o Tratamento”, que foi recentemente aprovado pela FAPESP.O trabalho aqui proposto visa a dar continuidade à pesquisa de doutorado da coordenadora Dra. Ariane Machado Lima sobre métodos computacionais de identificação de RNAs não codificantes [1, 2]. Embora o projeto de doutorado tenha sido desenvolvido para aplicação em qualquer organismo, grande parte dos estudos foram aplicados em Plasmodium falciparum, um parasita que causa a malária humana mais letal. Em seu pós-doutorado, a coordenadora irá se familiarizar com a aplicação em genoma humano e, especificamente, com uma nova área, estranha a ela, que é o estudo de fatores moleculares de doenças neuropsiquiátricas. Além disso, por ser cientista computacional de formação (graduação e mestrado) com doutorado em Bioinformática, a candidata irá também ampliar seus conhecimentos em uma outra área de grande relevância para este trabalho, a Estatística, sob supervisão do Dr. Carlos Alberto de Bragança Pereira.A fim de alcançar maior evolução na pesquisa, a pesquisadora pretende fazer um estágio no exterior, de 1 a 3 meses, em uma instituição ainda a ser definida e que apresente sólida pesquisa na área de ncRNAs em Neuropsiquiatria.

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MACHADO-LIMA‚ A.; KASHIWABARA‚ A.Y.; DURHAM‚ A.M. Decreasing the number of false positives in sequence classification. BMC Genomics, v. 11, n. Suppl 5, p. S10, 2010.
ORJUELA-SANCHEZ, PAMELA; DE SANTANA FILHO, FRANKLIN SIMOES; MACHADO-LIMA, ARIANE; CHEHUAN, YONNE FRANCIS; FARIAS COSTA, MONICA REGINA; COSTA ALECRIM, MARIA DAS GRACAS; DEL PORTILLO, HERNANDO A. Analysis of Single-Nucleotide Polymorphisms in the crt-o and mdr1 Genes of Plasmodium vivax among Chloroquine-Resistant Isolates from the Brazilian Amazon Region. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, v. 53, n. 8, p. 3561-3564, AUG 2009. Citações Web of Science: 42.
MELLO, BARBARA P.; ABRANTES, EDUARDO F.; TORRES, CESAR H.; MACHADO-LIMA, ARIANE; FONSECA, ROGRIO DA SILVA; CARRARO, DIRCE M.; BRENTANI, RICARDO R.; REIS, LUIZ F. L.; BRENTANI, HELENA. No-match ORESTES explored as tumor markers. Nucleic Acids Research, v. 37, n. 8, p. 2607-2617, MAY 2009. Citações Web of Science: 9.

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