Analise de novas interacoes proteina-proteina em febre amarela atraves de sistema duplo hibrido.

• Processo: 05/02925-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2006
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2007
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Maurício Lacerda Nogueira
• Beneficiário: Ana Carolina Viegas Carmo
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP). Secretaria de Desenvolvimento Econômico (São Paulo - Estado). São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Virologia Duplo-híbrido NS5 Febre amarela
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Duplo-Hibrido | Febre Amarela | Flavirus | Ns5 | Virologia | virologia

Resumo

O vírus da febre amarela (YF) é o protótipo da família Flaviviridae, uma família de vírus de RNA polaridade positiva. Três gêneros fazem parte desta família: Flavivírus, Pestivírus e Hepacivírus. O gênero Flavivírus é geralmente transmitido por artrópodes. Diversos agentes patogênicos para humanos e animais fazem parte da família Flaviviridae incluindo além do YF, o vírus da dengue, BVDV (Vírus da Diarréia Viral Bovina) e hepatite C. O YF tem um genoma de aproximadamente 11Kb com um cap na posição 5´ porém não é poliadenilado na posição 3´. Este genoma é codificado como uma única ORF levando a um polipepitídeo que é depois processado por proteases virais e celulares em diversas proteínas estruturais e não estruturais. A estrutura genômica é 5´-C-PreM-E-NS1-NS2A-NS2B-NS3-NS4A-NS4B-NS5-3´ A proteína de maior peso molecular do YF é a NS5. Com um peso molecular da ordem de 100KDa é altamente conservada entre os flavivírus. Tem atividade de RNA polimerase (na região carbóxi-terminal da proteína) e tem um motivo Gly-Asp-Asp conservado em diversos vírus de RNA polaridade positiva. Mutações em NS5 tem sido relacionada a uma menor virulência e atenuação da YF. NS5 é também identificada no núcleo de células infectadas com YF. Esta informação nos permite especular que NS5 tenha funções no núcleo celular, como a interação e modificação de proteínas e funções celulares. Diferentemente de NS5 de HCV e outros, pouco se sabe das interações proteína-proteína relacionadas a NS5 de YF. Como interações proteínas-proteína são de fundamental importância para ativação, regulação e controle de diversas funções enzimáticas relacionadas a estas, o conhecimento destas interações é de fundamental importância para o desenho racional de drogas e conhecimento da patogênese. Desta forma, o objetivo deste trabalho é identificar e caracterizar proteínas celulares que interagem com NS5. Este conhecimento pode nos levar a um melhor conhecimento das funções de NS5 em células infectadas, da base para a atenuação viral dependente de NS5 e possibilitar num futuro uma abordagem proteômica e química para o desenho de drogas para YF.