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Métodos computacionais para caracterização e análise de neurônios e glias

Processo: 07/02938-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de janeiro de 2008
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2009
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Metodologia e Técnicas da Computação
Pesquisador responsável:Luciano da Fontoura Costa
Beneficiário:Bruno Augusto Nassif Travençolo
Instituição-sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Assunto(s):Processamento de imagens   Expressão gênica   Neurônios

Resumo

Este projeto tem como objetivo desenvolver e aplicar métodos computacionais com a finalidade de estudar o desenvolvimento de neurônios e glias. A motivação principal deste estudo é entender o relacionamento que existe entre a forma, a função e a expressão gênica nessas células. As análises serão feitas por meio de imagens de microscopia de amostras biológicas, coletadas em duas e três dimensões, as quais serão aplicadas rotinas de processamento de imagens, análise de formas e visualização computacional. Com isso, será possível caracterizar os aspectos morfológicos e de expressão gênica de neurônios e glias e correlacionar essas características com o desenvolvimento e a função dessas células.

Publicações científicas (8)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
COMIN, CESAR H.; BATISTA, JOAO L. B.; VIANA, MATHEUS P.; COSTA, LUCIANO DA F.; TRAVENCOLO, BRUNO A. N.; KAISER, MARCUS. STRUCTURE AND DYNAMICS: THE TRANSITION FROM NONEQUILIBRIUM TO EQUILIBRIUM IN INTEGRATE-AND-FIRE DYNAMICS. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIFURCATION AND CHAOS, v. 22, n. 7 JUL 2012. Citações Web of Science: 2.
HOLLOWAY, DAVID M.; LOPES, FRANCISCO J. P.; COSTA, LUCIANO DA FONTOURA; TRAVENCOLO, BRUNO A. N.; GOLYANDINA, NINA; USEVICH, KONSTANTIN; SPIROV, ALEXANDER V. Gene Expression Noise in Spatial Patterning: hunchback Promoter Structure Affects Noise Amplitude and Distribution in Drosophila Segmentation. PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, v. 7, n. 2, p. e1001069, 2011. Citações Web of Science: 42.
SILVA, FILIPI NASCIMENTO; TRAVENCOLO, BRUNO A. N.; VIANA, MATHEUS P.; COSTA, LUCIANO DA FONTOURA. Identifying the borders of mathematical knowledge. Journal of Physics A-Mathematical and Theoretical, v. 43, n. 32 AUG 13 2010. Citações Web of Science: 5.
COSTA, L. DA F.; TRAVENCOLO, B. A. N.; VIANA, M. P.; STRANO, E. On the efficiency of transportation systems in large cities. EPL, v. 91, n. 1 JUL 2010. Citações Web of Science: 13.
VIANA, MATHEUS PALHARES; TRAVENCOLO, BRUNO A. N.; TANCK, ESTHER; COSTA, LUCIANO DA FONTOURA. Characterizing topological and dynamical properties of complex networks without border effects. PHYSICA A-STATISTICAL MECHANICS AND ITS APPLICATIONS, v. 389, n. 8, p. 1771-1778, APR 15 2010. Citações Web of Science: 5.
TREMBLAY, MARC; FUGERE, VINCENT; TSUI, JENNIFER; SCHOHL, ANNE; TAVAKOLI, AYDIN; TRAVENCOLO, BRUNO A. N.; COSTA, LUCIANO DA F.; RUTHAZER, EDWARD S. Regulation of Radial Glial Motility by Visual Experience. JOURNAL OF NEUROSCIENCE, v. 29, n. 45, p. 14066-14076, NOV 11 2009. Citações Web of Science: 21.
TRAVENCOLO, BRUNO A. N.; VIANA, MATHEUS PALHARES; COSTA, LUCIANO DA FONTOURA. Border detection in complex networks. NEW JOURNAL OF PHYSICS, v. 11, JUN 12 2009. Citações Web of Science: 17.
TRAVENCOLO, B. A. N.; COSTA, L. DA F. Accessibility in complex networks. Physics Letters A, v. 373, n. 1, p. 89-95, DEC 22 2008. Citações Web of Science: 52.

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